27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4737 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_4737  urate oxidase  100 
 
 
287 aa  597  1e-170  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2773  Urate oxidase  61.77 
 
 
293 aa  355  3.9999999999999996e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0501518  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5939  urate oxidase  55.75 
 
 
293 aa  315  6e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2592  urate oxidase  51.7 
 
 
301 aa  310  2e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.414807  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2838  urate oxidase  54.01 
 
 
292 aa  307  1.0000000000000001e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.228909  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1910  urate oxidase  51.03 
 
 
297 aa  306  2.0000000000000002e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.481639  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2538  urate oxidase  56.3 
 
 
273 aa  303  3.0000000000000004e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.224132  normal  0.25642 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0718  urate oxidase  52.58 
 
 
298 aa  301  7.000000000000001e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.434083  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0250  urate oxidase  49.66 
 
 
302 aa  301  9e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2243  urate oxidase  52.04 
 
 
301 aa  296  3e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0348041  decreased coverage  0.00681742 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3208  urate oxidase  50.51 
 
 
302 aa  288  1e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3427  urate oxidase  50.85 
 
 
302 aa  288  1e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.832721  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0238  urate oxidase  49.66 
 
 
297 aa  285  4e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2783  urate oxidase  51.04 
 
 
300 aa  279  3e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.458249  hitchhiker  0.0000164085 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2071  Urate oxidase  48.66 
 
 
299 aa  265  5e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08250  urate oxidase  47.18 
 
 
314 aa  255  7e-67  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.587674  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1142  urate oxidase  50.35 
 
 
289 aa  253  2.0000000000000002e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.207061  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6768  urate oxidase  40.93 
 
 
281 aa  236  3e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2843  urate oxidase  40.71 
 
 
294 aa  210  2e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0199  urate oxidase  35.25 
 
 
280 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.777167  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2601  urate oxidase  37.18 
 
 
293 aa  184  1.0000000000000001e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.4871  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5249  urate oxidase  36.03 
 
 
279 aa  176  3e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00435784 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_09470  Uricase (EC 1.7.3.3)(Urate oxidase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P33282]  34.72 
 
 
301 aa  164  2.0000000000000002e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5813  urate oxidase  34.93 
 
 
279 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40781  peroxisomal urate oxidase  32.08 
 
 
304 aa  152  8.999999999999999e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02420  uricase (Urate oxidase), putative  32.57 
 
 
311 aa  138  1e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0988341  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_29736  predicted protein  27.87 
 
 
247 aa  91.3  2e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.637212  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>