27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0250 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0250  urate oxidase  100 
 
 		 302 aa  632  1e-180  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2838  urate oxidase  63.25 
 
 		 292 aa  390  1e-107  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.228909  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4737  urate oxidase  49.66 
 
 		 287 aa  301  9e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1910  urate oxidase  49.34 
 
 		 297 aa  299  4e-80  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.481639  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2592  urate oxidase  49.83 
 
 		 301 aa  297  1e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.414807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5939  urate oxidase  51.37 
 
 		 293 aa  293  3e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0718  urate oxidase  49.34 
 
 		 298 aa  288  6e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.434083  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2783  urate oxidase  50.18 
 
 		 300 aa  279  4e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.458249  hitchhiker  0.0000164085 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2538  urate oxidase  49.1 
 
 		 273 aa  275  6e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.224132  normal  0.25642 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0238  urate oxidase  45.79 
 
 		 297 aa  272  5.000000000000001e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3427  urate oxidase  48.12 
 
 		 302 aa  271  9e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.832721  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3208  urate oxidase  46.94 
 
 		 302 aa  268  8e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2243  urate oxidase  47.39 
 
 		 301 aa  267  2e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0348041  decreased coverage  0.00681742 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2773  Urate oxidase  49.3 
 
 		 293 aa  258  7e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0501518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2071  Urate oxidase  46.64 
 
 		 299 aa  252  6e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1142  urate oxidase  46.81 
 
 		 289 aa  251  1e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.207061  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6768  urate oxidase  39.58 
 
 		 281 aa  227  1e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08250  urate oxidase  41.16 
 
 		 314 aa  228  1e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.587674  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2843  urate oxidase  39.64 
 
 		 294 aa  223  4e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2601  urate oxidase  39.27 
 
 		 293 aa  211  1e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.4871  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5249  urate oxidase  39.78 
 
 		 279 aa  205  8e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00435784 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5813  urate oxidase  39.78 
 
 		 279 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0199  urate oxidase  37.41 
 
 		 280 aa  186  5e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.777167  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_09470  Uricase (EC 1.7.3.3)(Urate oxidase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P33282]  34.47 
 
 		 301 aa  166  4e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40781  peroxisomal urate oxidase  31.53 
 
 		 304 aa  150  4e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02420  uricase (Urate oxidase), putative  31.35 
 
 		 311 aa  149  8e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0988341  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_29736  predicted protein  27.87 
 
 		 247 aa  88.2  1e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.637212  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>