27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5939 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5939  urate oxidase  100 
 
 		 293 aa  595  1e-169  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1910  urate oxidase  57.58 
 
 		 297 aa  343  2e-93  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.481639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2773  Urate oxidase  60.41 
 
 		 293 aa  342  2.9999999999999997e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0501518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2243  urate oxidase  58 
 
 		 301 aa  331  7.000000000000001e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0348041  decreased coverage  0.00681742 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2592  urate oxidase  56.15 
 
 		 301 aa  330  2e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.414807  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0718  urate oxidase  57.38 
 
 		 298 aa  326  4.0000000000000003e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.434083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4737  urate oxidase  55.75 
 
 		 287 aa  315  6e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2783  urate oxidase  57.97 
 
 		 300 aa  315  7e-85  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.458249  hitchhiker  0.0000164085 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0238  urate oxidase  54.88 
 
 		 297 aa  313  1.9999999999999998e-84  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3427  urate oxidase  53.02 
 
 		 302 aa  305  7e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.832721  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3208  urate oxidase  51.34 
 
 		 302 aa  293  2e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0250  urate oxidase  51.37 
 
 		 302 aa  293  3e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2538  urate oxidase  56.57 
 
 		 273 aa  292  4e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.224132  normal  0.25642 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1142  urate oxidase  55.12 
 
 		 289 aa  278  8e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.207061  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2838  urate oxidase  52.96 
 
 		 292 aa  276  4e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.228909  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2071  Urate oxidase  51.34 
 
 		 299 aa  273  2.0000000000000002e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08250  urate oxidase  47.42 
 
 		 314 aa  271  9e-72  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.587674  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2843  urate oxidase  47.14 
 
 		 294 aa  241  1e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6768  urate oxidase  43.46 
 
 		 281 aa  236  3e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2601  urate oxidase  43.8 
 
 		 293 aa  211  7.999999999999999e-54  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.4871  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5813  urate oxidase  39.56 
 
 		 279 aa  178  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0199  urate oxidase  35.84 
 
 		 280 aa  167  1e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.777167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5249  urate oxidase  37.36 
 
 		 279 aa  165  8e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00435784 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02420  uricase (Urate oxidase), putative  36.39 
 
 		 311 aa  160  2e-38  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0988341  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_09470  Uricase (EC 1.7.3.3)(Urate oxidase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P33282]  37.02 
 
 		 301 aa  155  6e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40781  peroxisomal urate oxidase  33.11 
 
 		 304 aa  151  1e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_29736  predicted protein  33.61 
 
 		 247 aa  109  7.000000000000001e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.637212  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>