27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2783 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_2783  urate oxidase  100 
 
 
300 aa  606  9.999999999999999e-173  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.458249  hitchhiker  0.0000164085 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1142  urate oxidase  71.17 
 
 
289 aa  378  1e-104  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.207061  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3427  urate oxidase  60.4 
 
 
302 aa  362  3e-99  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.832721  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3208  urate oxidase  60.07 
 
 
302 aa  362  5.0000000000000005e-99  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2243  urate oxidase  60.74 
 
 
301 aa  353  2.9999999999999997e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0348041  decreased coverage  0.00681742 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0238  urate oxidase  59.12 
 
 
297 aa  351  7e-96  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1910  urate oxidase  59.18 
 
 
297 aa  346  2e-94  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.481639  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0718  urate oxidase  59.8 
 
 
298 aa  338  7e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.434083  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2592  urate oxidase  57.72 
 
 
301 aa  337  9.999999999999999e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.414807  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08250  urate oxidase  54.21 
 
 
314 aa  323  3e-87  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.587674  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5939  urate oxidase  57.97 
 
 
293 aa  315  7e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2071  Urate oxidase  51.18 
 
 
299 aa  287  1e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2538  urate oxidase  53.07 
 
 
273 aa  280  2e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.224132  normal  0.25642 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4737  urate oxidase  51.04 
 
 
287 aa  279  3e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0250  urate oxidase  50.18 
 
 
302 aa  279  4e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2773  Urate oxidase  50.69 
 
 
293 aa  256  4e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0501518  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2838  urate oxidase  51.23 
 
 
292 aa  252  7e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.228909  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2843  urate oxidase  47.86 
 
 
294 aa  246  3e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6768  urate oxidase  43.73 
 
 
281 aa  236  3e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2601  urate oxidase  45.13 
 
 
293 aa  228  1e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.4871  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5249  urate oxidase  43.01 
 
 
279 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00435784 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5813  urate oxidase  41.18 
 
 
279 aa  202  8e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_09470  Uricase (EC 1.7.3.3)(Urate oxidase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P33282]  37.16 
 
 
301 aa  186  4e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0199  urate oxidase  38.21 
 
 
280 aa  186  5e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.777167  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40781  peroxisomal urate oxidase  34.34 
 
 
304 aa  162  6e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02420  uricase (Urate oxidase), putative  35.41 
 
 
311 aa  159  5e-38  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0988341  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_29736  predicted protein  33.33 
 
 
247 aa  112  1.0000000000000001e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.637212  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>