27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2773 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_2773  Urate oxidase  100 
 
 
293 aa  605  9.999999999999999e-173  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0501518  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4737  urate oxidase  61.77 
 
 
287 aa  367  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5939  urate oxidase  60.41 
 
 
293 aa  352  4e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1910  urate oxidase  58.9 
 
 
297 aa  340  2e-92  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.481639  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2592  urate oxidase  56.27 
 
 
301 aa  329  3e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.414807  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0718  urate oxidase  57.63 
 
 
298 aa  317  1e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.434083  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2243  urate oxidase  55.07 
 
 
301 aa  310  2e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0348041  decreased coverage  0.00681742 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3208  urate oxidase  56.95 
 
 
302 aa  306  2.0000000000000002e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0238  urate oxidase  55.63 
 
 
297 aa  306  3e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3427  urate oxidase  55.59 
 
 
302 aa  305  6e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.832721  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2538  urate oxidase  57.04 
 
 
273 aa  300  3e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.224132  normal  0.25642 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2071  Urate oxidase  51.17 
 
 
299 aa  288  6e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1142  urate oxidase  52.16 
 
 
289 aa  275  6e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.207061  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0250  urate oxidase  49.3 
 
 
302 aa  273  2.0000000000000002e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2838  urate oxidase  50.68 
 
 
292 aa  273  3e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.228909  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2783  urate oxidase  50.69 
 
 
300 aa  268  7e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.458249  hitchhiker  0.0000164085 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6768  urate oxidase  42.4 
 
 
281 aa  242  6e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08250  urate oxidase  44.48 
 
 
314 aa  240  2e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.587674  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2843  urate oxidase  41.58 
 
 
294 aa  217  2e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2601  urate oxidase  40.07 
 
 
293 aa  193  3e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.4871  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0199  urate oxidase  36.82 
 
 
280 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.777167  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5813  urate oxidase  37.64 
 
 
279 aa  176  4e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40781  peroxisomal urate oxidase  35.42 
 
 
304 aa  173  2.9999999999999996e-42  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5249  urate oxidase  36.16 
 
 
279 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00435784 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_09470  Uricase (EC 1.7.3.3)(Urate oxidase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P33282]  35.89 
 
 
301 aa  164  1.0000000000000001e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02420  uricase (Urate oxidase), putative  35.71 
 
 
311 aa  158  1e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0988341  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_29736  predicted protein  32.24 
 
 
247 aa  107  2e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.637212  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>