More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2650 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_2650  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 
272 aa  561  1.0000000000000001e-159  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.676942 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2659  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  76.75 
 
 
279 aa  441  1e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.624906  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3144  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  79.61 
 
 
262 aa  437  1e-121  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2167  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  79.61 
 
 
261 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2807  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  61.79 
 
 
268 aa  337  9e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.377161 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2358  phosphate transporter ATP-binding protein  59.77 
 
 
273 aa  333  2e-90  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2480  phosphate transporter ATP-binding protein  61.54 
 
 
268 aa  332  3e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.685888 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1399  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  58.09 
 
 
273 aa  332  4e-90  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.5206 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2831  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  60.98 
 
 
273 aa  332  5e-90  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.830296 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3292  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  60.98 
 
 
273 aa  332  5e-90  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1089  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  61.09 
 
 
272 aa  328  4e-89  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.745288  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3638  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  58.76 
 
 
267 aa  326  2.0000000000000001e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000916154  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2334  phosphate ABC transporter ATPase subunit  60.38 
 
 
268 aa  326  2.0000000000000001e-88  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08631  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  59.69 
 
 
270 aa  324  1e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.296362  hitchhiker  0.00137214 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15211  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  60.7 
 
 
272 aa  322  3e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.461543 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0586  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  60.55 
 
 
272 aa  322  4e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.518906 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07771  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  60.47 
 
 
269 aa  322  5e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.71775  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0333  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  59.92 
 
 
306 aa  321  7e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0100959 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4000  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  58.71 
 
 
265 aa  321  7e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0729  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  60.47 
 
 
269 aa  321  9.000000000000001e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4154  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  60.55 
 
 
272 aa  320  9.999999999999999e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.914841  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3291  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  60.16 
 
 
264 aa  320  9.999999999999999e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2832  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  60.16 
 
 
264 aa  320  9.999999999999999e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.814332 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08641  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  60.47 
 
 
269 aa  320  9.999999999999999e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0289  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  59.23 
 
 
288 aa  320  1.9999999999999998e-86  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.234131  normal  0.242396 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07771  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  60.47 
 
 
269 aa  319  3e-86  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.263903  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2214  phosphate ABC transporter ATPase subunit  61.69 
 
 
304 aa  317  1e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.809331  normal  0.200846 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2808  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  59.18 
 
 
265 aa  317  1e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.325814 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1902  phosphate ABC transporter permease  56.86 
 
 
289 aa  316  2e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.462595  decreased coverage  0.00664679 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2441  phosphate transporter ATP-binding protein  57.47 
 
 
264 aa  316  2e-85  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.593551  normal  0.0208072 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3540  response regulator receiver protein  58.37 
 
 
273 aa  316  2e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09821  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  57.98 
 
 
267 aa  315  6e-85  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.77001  normal  0.371383 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0309  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  59.68 
 
 
267 aa  315  6e-85  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.273467  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5391  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  57.81 
 
 
290 aa  310  1e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0048  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  58.7 
 
 
275 aa  310  2e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.240899  normal  0.357685 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3423  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  60.16 
 
 
259 aa  302  3.0000000000000004e-81  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0224  phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  60.4 
 
 
259 aa  302  4.0000000000000003e-81  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2079  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  61.2 
 
 
259 aa  302  5.000000000000001e-81  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0661  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  59.77 
 
 
259 aa  301  6.000000000000001e-81  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.493036  hitchhiker  0.000268199 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0590  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  59.61 
 
 
258 aa  301  1e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2890  phosphate transporter ATP-binding protein  58.54 
 
 
252 aa  299  3e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0597569 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0355  phosphate transporter ATP-binding protein  59.51 
 
 
258 aa  298  8e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.584479  normal  0.0138641 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4262  phosphate transporter ATP-binding protein  58.43 
 
 
258 aa  298  9e-80  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1069  phosphate transporter ATp-binding protein  57.81 
 
 
259 aa  297  1e-79  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2743  phosphate ABC transporter permease  58.2 
 
 
259 aa  297  1e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00299446  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0205  phosphate transporter ATP-binding protein  58 
 
 
259 aa  296  2e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1928  phosphate transporter ATP-binding protein  56.25 
 
 
251 aa  295  6e-79  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.333841  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0365  phosphate transporter ATP-binding protein  58.4 
 
 
259 aa  294  1e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4260  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  57.98 
 
 
259 aa  294  1e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0881  phosphate transporter ATP-binding protein  57.31 
 
 
255 aa  293  2e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0906767 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31840  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  57.03 
 
 
259 aa  293  2e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1599  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  56.08 
 
 
278 aa  293  2e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4495  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  52.88 
 
 
301 aa  292  4e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.583494 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21550  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  58.54 
 
 
253 aa  291  7e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0505  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  54.47 
 
 
276 aa  291  1e-77  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.497855 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2601  phosphate transporter ATP-binding protein  54.01 
 
 
265 aa  290  2e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2222  phosphate transporter ATP-binding protein  54.2 
 
 
264 aa  290  2e-77  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.150141 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1790  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  54.09 
 
 
297 aa  290  2e-77  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.530432  decreased coverage  0.00975681 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1259  phosphate transporter ATP-binding protein  54.01 
 
 
265 aa  290  2e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8263  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  58.3 
 
 
258 aa  289  3e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.689051 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4148  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  58.7 
 
 
286 aa  289  4e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37650  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  58.23 
 
 
259 aa  289  4e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0806666 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2267  phosphate transporter ATP-binding protein  52.36 
 
 
303 aa  289  4e-77  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0872  phosphate transporter ATP-binding protein  57.83 
 
 
258 aa  288  5.0000000000000004e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.127902  normal  0.142504 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0491  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  54.55 
 
 
345 aa  288  6e-77  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0954  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  52.98 
 
 
276 aa  288  8e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.222469  normal  0.101255 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1922  phosphate transporter ATP-binding protein  54.41 
 
 
265 aa  287  1e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.588083 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2965  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  58 
 
 
262 aa  287  1e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2831  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  55.65 
 
 
252 aa  286  2e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2961  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  57.6 
 
 
259 aa  286  2.9999999999999996e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4327  phosphate transporter ATP-binding protein  53.31 
 
 
265 aa  286  2.9999999999999996e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.172468  normal  0.997199 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1137  phosphate transporter ATP-binding protein  54.34 
 
 
285 aa  285  5e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.326059  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0421  phosphate transporter ATP-binding protein  57.26 
 
 
260 aa  285  7e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.846145 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1910  phosphate transporter ATP-binding protein  57.26 
 
 
256 aa  285  7e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.57723  normal  0.261135 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1963  phosphate transporter ATP-binding protein  55.47 
 
 
253 aa  284  8e-76  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0821  phosphate ABC transporter permease  55.56 
 
 
286 aa  285  8e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1536  phosphate transporter ATP-binding protein  56.28 
 
 
264 aa  284  8e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.424595  normal  0.394597 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0092  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  57.09 
 
 
255 aa  284  9e-76  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2279  phosphate transporter ATP-binding protein  53.31 
 
 
275 aa  284  9e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0589752  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4651  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  56.64 
 
 
259 aa  283  1.0000000000000001e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1259  phosphate transporter ATP-binding protein  56.28 
 
 
265 aa  284  1.0000000000000001e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0709  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  55.51 
 
 
251 aa  283  1.0000000000000001e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0354  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  54.25 
 
 
301 aa  283  2.0000000000000002e-75  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0142036  normal  0.246241 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1079  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  53.7 
 
 
252 aa  282  3.0000000000000004e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.376922  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48570  phosphate transporter ATP-binding protein  55.08 
 
 
277 aa  283  3.0000000000000004e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.253106  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4381  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  55.86 
 
 
259 aa  283  3.0000000000000004e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2740  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  55.87 
 
 
281 aa  282  4.0000000000000003e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.37643  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1929  phosphate transporter ATP-binding protein  53.44 
 
 
305 aa  282  4.0000000000000003e-75  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0381146  normal  0.0357892 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1781  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  55.69 
 
 
258 aa  282  4.0000000000000003e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05140  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  56.68 
 
 
249 aa  281  6.000000000000001e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0066  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  56.68 
 
 
251 aa  281  7.000000000000001e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0711697  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2104  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  55.06 
 
 
252 aa  281  8.000000000000001e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4414  phosphate transporter ATP-binding protein  51.09 
 
 
276 aa  281  9e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.148952  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5234  phosphate transporter ATP-binding protein  54.3 
 
 
277 aa  280  1e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.634569  normal  0.16068 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2983  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  52.82 
 
 
253 aa  280  1e-74  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1013  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  56.25 
 
 
251 aa  281  1e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1569  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  54.25 
 
 
251 aa  281  1e-74  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0572  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  53.31 
 
 
251 aa  280  1e-74  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8334  phosphate ABC transporter permease  56.68 
 
 
258 aa  281  1e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4145  phosphate transporter ATP-binding protein  57.09 
 
 
262 aa  280  1e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>