More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_2601 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_1259  phosphate transporter ATP-binding protein  100 
 
 
265 aa  545  1e-154  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2601  phosphate transporter ATP-binding protein  100 
 
 
265 aa  545  1e-154  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1922  phosphate transporter ATP-binding protein  92.83 
 
 
265 aa  513  1e-144  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.588083 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1536  phosphate transporter ATP-binding protein  82.26 
 
 
264 aa  463  1e-129  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.424595  normal  0.394597 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4327  phosphate transporter ATP-binding protein  82.26 
 
 
265 aa  462  1e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.172468  normal  0.997199 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1259  phosphate transporter ATP-binding protein  78.49 
 
 
265 aa  444  1.0000000000000001e-124  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2292  phosphate transporter ATP-binding protein  73.14 
 
 
283 aa  430  1e-119  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0397  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  72.11 
 
 
284 aa  395  1e-109  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0489  phosphate transporter ATP-binding protein  71.32 
 
 
271 aa  394  1e-109  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.357305  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0122  phosphate transporter ATP-binding protein  73.49 
 
 
271 aa  394  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.341225 
 
 
-
 
NC_004310  BR2141  phosphate transporter ATP-binding protein  72.83 
 
 
257 aa  390  1e-108  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0601  phosphate transporter ATP-binding protein  72.58 
 
 
248 aa  392  1e-108  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.889031  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2279  phosphate transporter ATP-binding protein  69.96 
 
 
275 aa  390  1e-108  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0589752  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3118  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  72 
 
 
291 aa  392  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0430987  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0481  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  73.6 
 
 
263 aa  391  1e-108  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.180726  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1074  phosphate transporter ATP-binding protein  73.58 
 
 
247 aa  389  1e-107  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.566041  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4548  phosphate transporter ATP-binding protein  71.37 
 
 
302 aa  390  1e-107  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.662956  normal  0.262151 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2056  phosphate transporter ATP-binding protein  72.83 
 
 
257 aa  390  1e-107  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.12029  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1541  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  74.3 
 
 
265 aa  389  1e-107  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000871214  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0181  phosphate transporter ATP-binding protein  70.16 
 
 
271 aa  386  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.353351 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0768  phosphate transporter ATP-binding protein  71.26 
 
 
273 aa  386  1e-106  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0255819  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0171  phosphate transporter ATP-binding protein  70.16 
 
 
271 aa  386  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3752  phosphate transporter ATP-binding protein  69.84 
 
 
293 aa  379  1e-104  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.600965 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2406  ABC phosphate transporter ATP-binding protein  67.84 
 
 
275 aa  377  1e-104  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0506125 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3626  phosphate transporter ATP-binding protein  69.17 
 
 
295 aa  380  1e-104  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.926867  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0823  phosphate transporter ATP-binding protein  71.49 
 
 
260 aa  376  1e-103  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00511308 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3315  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  66.93 
 
 
290 aa  365  1e-100  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0283925  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1225  phosphate transporter ATP-binding protein  66.53 
 
 
252 aa  365  1e-100  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.315326  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1231  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  67.47 
 
 
281 aa  363  2e-99  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.758755 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21550  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  65.74 
 
 
253 aa  349  2e-95  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2831  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  63.86 
 
 
252 aa  345  3e-94  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0469  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  62.55 
 
 
254 aa  344  8.999999999999999e-94  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0621  phosphate transporter ATP-binding protein  62.75 
 
 
253 aa  341  5.999999999999999e-93  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.118922  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0607  phosphate transporter ATP-binding protein  62.75 
 
 
253 aa  341  5.999999999999999e-93  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.080383  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0622  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  63.05 
 
 
269 aa  341  7e-93  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.970932  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0586  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  64.37 
 
 
272 aa  340  1e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.518906 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1963  phosphate transporter ATP-binding protein  61.45 
 
 
253 aa  339  2e-92  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1856  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  57.48 
 
 
273 aa  339  2e-92  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0498  phosphate ABC transporter permease  61.45 
 
 
254 aa  339  2.9999999999999998e-92  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2983  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  61.9 
 
 
253 aa  339  2.9999999999999998e-92  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1479  phosphate ABC transporter permease  60.32 
 
 
260 aa  338  4e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1928  phosphate transporter ATP-binding protein  64.4 
 
 
251 aa  338  5.9999999999999996e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.333841  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3638  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  63.24 
 
 
267 aa  337  8e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000916154  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2660  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  62.45 
 
 
253 aa  337  9e-92  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4154  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  59.7 
 
 
272 aa  337  9e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.914841  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0092  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  61.9 
 
 
255 aa  336  1.9999999999999998e-91  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1236  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  59.53 
 
 
286 aa  337  1.9999999999999998e-91  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.534632  normal  0.227488 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0486  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  58.57 
 
 
251 aa  334  1e-90  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1569  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  59.36 
 
 
251 aa  334  1e-90  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0881  phosphate transporter ATP-binding protein  63.24 
 
 
255 aa  333  1e-90  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0906767 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0954  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  60.78 
 
 
276 aa  333  2e-90  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.222469  normal  0.101255 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1910  phosphate transporter ATP-binding protein  62.95 
 
 
256 aa  333  2e-90  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.57723  normal  0.261135 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0350  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  59.36 
 
 
251 aa  332  4e-90  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.000161831 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0289  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  62.8 
 
 
288 aa  331  7.000000000000001e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.234131  normal  0.242396 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0114  phosphate ABC transporter permease  63.86 
 
 
252 aa  331  7.000000000000001e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5391  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  57.51 
 
 
290 aa  331  9e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0379  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  61.04 
 
 
254 aa  331  9e-90  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.198087  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0709  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  62.65 
 
 
251 aa  331  1e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48570  phosphate transporter ATP-binding protein  61.57 
 
 
277 aa  330  1e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.253106  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1013  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  62.8 
 
 
251 aa  330  1e-89  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4289  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  61.04 
 
 
249 aa  329  2e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0946  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  60.73 
 
 
287 aa  330  2e-89  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.754172 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1079  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  62.95 
 
 
252 aa  330  2e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.376922  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70810  phosphate transporter ATP-binding protein  60.78 
 
 
277 aa  329  2e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.356471 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0572  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  58.96 
 
 
251 aa  329  3e-89  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2104  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  60.64 
 
 
252 aa  329  3e-89  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0621  phosphate transporter ATP-binding protein  61.69 
 
 
261 aa  329  3e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6145  phosphate transporter ATP-binding protein  60.78 
 
 
277 aa  329  3e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0333  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  62.4 
 
 
306 aa  329  3e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0100959 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1242  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  60.73 
 
 
286 aa  328  5.0000000000000004e-89  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.867725  normal  0.755467 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1416  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  62.55 
 
 
251 aa  328  5.0000000000000004e-89  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00175163  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2548  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  65.42 
 
 
292 aa  328  6e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.126141 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3540  response regulator receiver protein  57.98 
 
 
273 aa  328  6e-89  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1617  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  60.32 
 
 
284 aa  327  1.0000000000000001e-88  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.336518  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1483  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  58.8 
 
 
249 aa  327  1.0000000000000001e-88  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00537874  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2386  phosphate transporter ATP-binding protein  62.06 
 
 
253 aa  327  1.0000000000000001e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00455032  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1679  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  58.37 
 
 
286 aa  327  1.0000000000000001e-88  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0234903  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3291  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  58.02 
 
 
264 aa  326  2.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1781  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  59.22 
 
 
258 aa  326  2.0000000000000001e-88  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4145  phosphate transporter ATP-binding protein  62.25 
 
 
262 aa  326  2.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2832  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  58.02 
 
 
264 aa  326  2.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.814332 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2890  phosphate transporter ATP-binding protein  61.6 
 
 
252 aa  326  2.0000000000000001e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0597569 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4119  phosphate transporter ATP-binding protein  61.85 
 
 
262 aa  326  3e-88  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1992  phosphate transporter ATP-binding protein  59.44 
 
 
249 aa  325  4.0000000000000003e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2650  phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  61.51 
 
 
285 aa  325  4.0000000000000003e-88  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.567129  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4000  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  58.89 
 
 
265 aa  325  4.0000000000000003e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0505  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  60.62 
 
 
276 aa  325  4.0000000000000003e-88  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.497855 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4003  phosphate transporter ATP-binding protein  61.85 
 
 
262 aa  325  5e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0423  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  56.4 
 
 
251 aa  324  7e-88  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0590  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  62.11 
 
 
258 aa  324  8.000000000000001e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4231  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  61.04 
 
 
249 aa  324  9e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5038  phosphate transporter ATP-binding protein  59.16 
 
 
277 aa  323  1e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.268746  normal  0.333592 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1700  phosphate transporter ATP-binding protein  59.61 
 
 
272 aa  323  1e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.870147 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1359  phosphate transporter ATP-binding protein  60.87 
 
 
272 aa  323  2e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0675287  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1041  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  60.32 
 
 
284 aa  323  2e-87  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000353293  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1919  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  58.1 
 
 
253 aa  323  2e-87  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.603751  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0910  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  59.62 
 
 
305 aa  322  3e-87  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0182  phosphate transporter ATP-binding protein  62.66 
 
 
277 aa  322  3e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0749  ABC phosphate transporter, ATPase subunit  58.75 
 
 
255 aa  322  3e-87  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000330265  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4495  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  59.77 
 
 
301 aa  322  3e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.583494 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>