More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0224 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0224  phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 259 aa  536  1e-151  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1069  phosphate transporter ATp-binding protein  93.05 
 
 		 259 aa  503  1e-141  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2965  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  76.06 
 
 		 262 aa  422  1e-117  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2961  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  75.68 
 
 		 259 aa  421  1e-117  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0365  phosphate transporter ATP-binding protein  76.45 
 
 		 259 aa  421  1e-117  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0205  phosphate transporter ATP-binding protein  75.29 
 
 		 259 aa  412  1e-114  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0661  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  74.52 
 
 		 259 aa  409  1e-113  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.493036  hitchhiker  0.000268199 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2079  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  72.97 
 
 		 259 aa  408  1e-113  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06970  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  73.75 
 
 		 259 aa  405  1.0000000000000001e-112  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3423  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  74.13 
 
 		 259 aa  406  1.0000000000000001e-112  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4260  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  73.75 
 
 		 259 aa  405  1.0000000000000001e-112  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31840  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  72.97 
 
 		 259 aa  405  1.0000000000000001e-112  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2743  phosphate ABC transporter permease  72.2 
 
 		 259 aa  402  1e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00299446  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4381  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  72.59 
 
 		 259 aa  399  9.999999999999999e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4651  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  72.2 
 
 		 259 aa  399  9.999999999999999e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4978  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  71.04 
 
 		 259 aa  388  1e-107  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01640  PstB  69.5 
 
 		 259 aa  389  1e-107  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0872  phosphate transporter ATP-binding protein  72.2 
 
 		 258 aa  389  1e-107  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.127902  normal  0.142504 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37650  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  70.27 
 
 		 259 aa  386  1e-106  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0806666 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4262  phosphate transporter ATP-binding protein  71.43 
 
 		 258 aa  384  1e-106  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25590  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  70.43 
 
 		 261 aa  385  1e-106  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.153524  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0355  phosphate transporter ATP-binding protein  69.88 
 
 		 258 aa  378  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.584479  normal  0.0138641 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0590  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  69.88 
 
 		 258 aa  378  1e-104  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8334  phosphate ABC transporter permease  68.73 
 
 		 258 aa  379  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5089  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  71.04 
 
 		 256 aa  368  1e-101  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8263  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  67.95 
 
 		 258 aa  366  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.689051 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6818  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  71.43 
 
 		 258 aa  365  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.988375  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3923  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  70.66 
 
 		 258 aa  365  1e-100  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1664  phosphate transporter ATP-binding protein  70.66 
 
 		 258 aa  366  1e-100  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2936  phosphate ABC transporter ATPase subunit  68.73 
 
 		 258 aa  367  1e-100  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3540  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  69.88 
 
 		 258 aa  363  2e-99  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.702552  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4899  phosphate transporter ATP-binding protein  70.27 
 
 		 258 aa  358  4e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4516  phosphate transporter ATP-binding protein  70.27 
 
 		 258 aa  358  4e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4603  phosphate transporter ATP-binding protein  70.27 
 
 		 258 aa  358  4e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10835  phosphate transporter ATP-binding protein  69.08 
 
 		 258 aa  354  6.999999999999999e-97  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00180319 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0094  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  63.71 
 
 		 257 aa  342  4e-93  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4154  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  61.57 
 
 		 272 aa  333  1e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.914841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0821  phosphate ABC transporter permease  61.96 
 
 		 286 aa  333  2e-90  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3638  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  59.61 
 
 		 267 aa  326  2.0000000000000001e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000916154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0586  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  59.61 
 
 		 272 aa  326  2.0000000000000001e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.518906 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2740  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  61.18 
 
 		 281 aa  316  2e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.37643  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4000  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  59.61 
 
 		 265 aa  317  2e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1489  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  59.77 
 
 		 260 aa  315  6e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2369  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  59.77 
 
 		 260 aa  315  6e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2334  phosphate ABC transporter ATPase subunit  60.87 
 
 		 268 aa  314  7e-85  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2807  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  58.53 
 
 		 268 aa  314  9.999999999999999e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.377161 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2480  phosphate transporter ATP-binding protein  57.36 
 
 		 268 aa  312  2.9999999999999996e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.685888 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2808  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  58.66 
 
 		 265 aa  311  5.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.325814 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3291  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  55.81 
 
 		 264 aa  311  6.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2832  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  55.81 
 
 		 264 aa  311  6.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.814332 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0653  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  59.77 
 
 		 282 aa  310  1e-83  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.316011 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2629  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  59.38 
 
 		 260 aa  310  1e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.119732  normal  0.10241 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21550  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  60.16 
 
 		 253 aa  310  2e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3540  response regulator receiver protein  56.98 
 
 		 273 aa  310  2e-83  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4915  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  58.59 
 
 		 260 aa  309  2.9999999999999997e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.508237  normal  0.341234 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2704  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  59.07 
 
 		 252 aa  309  2.9999999999999997e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0709  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  59.46 
 
 		 251 aa  308  4e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0333  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  57.36 
 
 		 306 aa  308  6.999999999999999e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0100959 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0289  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  57.36 
 
 		 288 aa  307  1.0000000000000001e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.234131  normal  0.242396 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2521  phosphate ABC transporter ATPase subunit  57.92 
 
 		 273 aa  306  3e-82  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0748442  normal  0.186434 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1139  phosphate transport system permease protein 1  57.65 
 
 		 260 aa  305  4.0000000000000004e-82  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.89911  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48570  phosphate transporter ATP-binding protein  60 
 
 		 277 aa  305  5.0000000000000004e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.253106  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5391  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  58.53 
 
 		 290 aa  305  6e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1715  phosphate transporter ATP-binding protein  57.42 
 
 		 263 aa  305  7e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.141839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2358  phosphate transporter ATP-binding protein  57.36 
 
 		 273 aa  304  8.000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1013  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  58.69 
 
 		 251 aa  304  1.0000000000000001e-81  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2811  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  58.59 
 
 		 261 aa  304  1.0000000000000001e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1905  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  59.07 
 
 		 250 aa  303  2.0000000000000002e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2023  phosphate transporter ATP-binding protein  57.03 
 
 		 263 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.157085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2222  phosphate transporter ATP-binding protein  57.42 
 
 		 264 aa  302  3.0000000000000004e-81  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.150141 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2650  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  60.4 
 
 		 272 aa  302  4.0000000000000003e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.676942 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0539  phosphate ABC transporter permease  58.04 
 
 		 272 aa  301  7.000000000000001e-81  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1856  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  55.86 
 
 		 273 aa  301  7.000000000000001e-81  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2831  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  55.34 
 
 		 273 aa  301  7.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.830296 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3292  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  55.34 
 
 		 273 aa  301  7.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0015  phosphate transporter ATP-binding protein  55.86 
 
 		 258 aa  301  9e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.426365  normal  0.139833 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0182  phosphate transporter ATP-binding protein  59.61 
 
 		 277 aa  301  9e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5326  phosphate transporter ATP-binding protein  59.22 
 
 		 281 aa  300  1e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.364055  normal  0.0105558 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4587  phosphate transporter ATP-binding protein  55.86 
 
 		 257 aa  300  1e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4579  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  55.08 
 
 		 272 aa  300  1e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.723553  normal  0.288742 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4266  phosphate transporter ATP-binding protein  55.86 
 
 		 257 aa  300  1e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0148  phosphate transporter ATP-binding protein  58.91 
 
 		 277 aa  301  1e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1259  phosphate transporter ATP-binding protein  58.2 
 
 		 265 aa  300  1e-80  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2314  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  57.42 
 
 		 259 aa  300  1e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.422428  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5234  phosphate transporter ATP-binding protein  59.22 
 
 		 277 aa  300  2e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.634569  normal  0.16068 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5373  phosphate transporter ATP-binding protein  58.53 
 
 		 277 aa  300  2e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417045 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4148  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  58.08 
 
 		 286 aa  300  2e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4002  phosphate transporter ATP-binding protein  55.08 
 
 		 258 aa  300  2e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0572  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  57.14 
 
 		 251 aa  300  2e-80  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3411  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  56.42 
 
 		 258 aa  299  2e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.30355 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4211  phosphate transporter ATP-binding protein  54.65 
 
 		 258 aa  299  2e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1929  phosphate transporter ATP-binding protein  57.03 
 
 		 305 aa  299  3e-80  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0381146  normal  0.0357892 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1479  phosphate ABC transporter permease  58.43 
 
 		 260 aa  299  3e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2831  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  55.86 
 
 		 252 aa  299  3e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2203  phosphate transporter ATP-binding protein  57.42 
 
 		 260 aa  299  3e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.574176  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4242  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  55.47 
 
 		 257 aa  298  4e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0309  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  53.85 
 
 		 267 aa  299  4e-80  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.273467  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1399  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  55.6 
 
 		 273 aa  299  4e-80  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.5206 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4236  phosphate transporter ATP-binding protein  55.47 
 
 		 257 aa  298  4e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4089  phosphate transporter ATP-binding protein  55.47 
 
 		 257 aa  298  4e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.85473 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>