44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2032 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_2032  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  100 
 
 		 353 aa  725    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4806  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  71.22 
 
 		 364 aa  523  1e-147  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0968745 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5273  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  70.93 
 
 		 364 aa  518  1e-146  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.619471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3728  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  71.95 
 
 		 353 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0231345 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5351  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  70.64 
 
 		 364 aa  513  1e-144  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.609865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6407  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  68.27 
 
 		 353 aa  509  1e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1838  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  70.11 
 
 		 362 aa  510  1e-143  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.201979 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1323  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  62.79 
 
 		 364 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0942361 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3971  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  63.66 
 
 		 365 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.209511  normal  0.408306 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3726  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  62.21 
 
 		 367 aa  461  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00000205151  hitchhiker  0.00410479 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1740  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  62.5 
 
 		 365 aa  458  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1000  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  62.79 
 
 		 363 aa  444  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1938  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  61.92 
 
 		 363 aa  437  1e-121  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.236638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0294  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  61.22 
 
 		 363 aa  437  1e-121  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.696744  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3544  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  57.39 
 
 		 373 aa  422  1e-117  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.829444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0151  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  56.27 
 
 		 373 aa  411  1e-113  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1285  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  50.45 
 
 		 375 aa  341  1e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.308511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1905  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  49.39 
 
 		 371 aa  330  2e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.720634  hitchhiker  0.00399105 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1541  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  49.39 
 
 		 371 aa  328  6e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00244092 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0728  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  47.32 
 
 		 358 aa  311  1e-83  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.258691 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2963  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester aerobic oxidative cyclase  47.56 
 
 		 358 aa  310  2.9999999999999997e-83  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.402608  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1310  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  48.33 
 
 		 356 aa  309  5e-83  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.504698 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1907  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  47.88 
 
 		 358 aa  307  1.0000000000000001e-82  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.256678  normal  0.714335 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2312  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  45.86 
 
 		 358 aa  307  2.0000000000000002e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.39272 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2261  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  45.86 
 
 		 358 aa  307  2.0000000000000002e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1165  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  46.94 
 
 		 362 aa  304  2.0000000000000002e-81  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.786161  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4958  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  46.63 
 
 		 358 aa  299  4e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4340  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  44.01 
 
 		 358 aa  295  8e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3134  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  44.64 
 
 		 358 aa  286  4e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_47501  predicted protein  42.18 
 
 		 360 aa  280  2e-74  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.457729  normal  0.356173 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09201  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  39.64 
 
 		 390 aa  266  4e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2605  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  40.49 
 
 		 358 aa  263  4e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4781  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  40 
 
 		 355 aa  260  3e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.724594  normal  0.125106 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3391  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester aerobic oxidative cyclase  39.57 
 
 		 358 aa  259  4e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3705  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  40.72 
 
 		 359 aa  257  2e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3758  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  40.72 
 
 		 359 aa  257  2e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.374624  normal  0.835463 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10241  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  42.68 
 
 		 390 aa  251  1e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0952559  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0956  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  42.24 
 
 		 390 aa  251  1e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4776  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  38.04 
 
 		 358 aa  250  3e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.554063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10251  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  39.6 
 
 		 390 aa  248  1e-64  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08941  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  38.04 
 
 		 367 aa  195  9e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.358951  hitchhiker  0.0000747917 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0227  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  38.04 
 
 		 368 aa  195  1e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  decreased coverage  0.00949985  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29201  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  38.49 
 
 		 349 aa  183  5.0000000000000004e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09191  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  36.23 
 
 		 349 aa  182  7e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.145742  hitchhiker  0.00000169211 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>