44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0294 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_0294  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  100 
 
 		 363 aa  752    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.696744  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1000  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  92.29 
 
 		 363 aa  701    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1938  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  98.62 
 
 		 363 aa  743    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.236638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3544  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  68.75 
 
 		 373 aa  525  1e-148  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.829444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0151  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  71.22 
 
 		 373 aa  520  1e-146  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1838  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  60.77 
 
 		 362 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.201979 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4806  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  60.44 
 
 		 364 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0968745 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5273  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  60.66 
 
 		 364 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.619471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5351  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  59.34 
 
 		 364 aa  442  1e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.609865  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2032  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  61.92 
 
 		 353 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3728  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  61.49 
 
 		 353 aa  435  1e-121  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0231345 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6407  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  58.72 
 
 		 353 aa  429  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3726  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  57.06 
 
 		 367 aa  421  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00000205151  hitchhiker  0.00410479 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1740  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  56.08 
 
 		 365 aa  419  1e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1323  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  54.12 
 
 		 364 aa  414  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0942361 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3971  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  54.97 
 
 		 365 aa  413  1e-114  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.209511  normal  0.408306 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1907  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  52.67 
 
 		 358 aa  303  3.0000000000000004e-81  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.256678  normal  0.714335 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1541  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  48.82 
 
 		 371 aa  303  4.0000000000000003e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00244092 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1285  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  46.69 
 
 		 375 aa  301  8.000000000000001e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.308511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1310  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  47.63 
 
 		 356 aa  299  7e-80  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.504698 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1905  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  48.06 
 
 		 371 aa  298  8e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.720634  hitchhiker  0.00399105 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1165  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  47.57 
 
 		 362 aa  297  2e-79  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.786161  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4340  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  43.43 
 
 		 358 aa  294  1e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2312  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  45.7 
 
 		 358 aa  293  2e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.39272 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2261  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  45.7 
 
 		 358 aa  293  2e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0728  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  44.87 
 
 		 358 aa  293  3e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.258691 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4958  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  50.18 
 
 		 358 aa  290  4e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2963  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester aerobic oxidative cyclase  48.18 
 
 		 358 aa  286  4e-76  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.402608  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3134  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  46.84 
 
 		 358 aa  283  3.0000000000000004e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_47501  predicted protein  44.79 
 
 		 360 aa  283  4.0000000000000003e-75  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.457729  normal  0.356173 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4781  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  43.47 
 
 		 355 aa  281  2e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.724594  normal  0.125106 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2605  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  44.26 
 
 		 358 aa  271  1e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3758  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  40.18 
 
 		 359 aa  268  2e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.374624  normal  0.835463 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3705  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  40.18 
 
 		 359 aa  268  2e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3391  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester aerobic oxidative cyclase  39.52 
 
 		 358 aa  253  4.0000000000000004e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0956  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  44.12 
 
 		 390 aa  251  1e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10241  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  42.24 
 
 		 390 aa  249  4e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0952559  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10251  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  43.46 
 
 		 390 aa  246  4e-64  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4776  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  39.72 
 
 		 358 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.554063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09201  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  39.88 
 
 		 390 aa  243  3e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08941  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  34.93 
 
 		 367 aa  210  3e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.358951  hitchhiker  0.0000747917 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0227  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  34.93 
 
 		 368 aa  210  3e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  decreased coverage  0.00949985  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29201  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  36.14 
 
 		 349 aa  203  5e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09191  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  33.74 
 
 		 349 aa  200  3e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.145742  hitchhiker  0.00000169211 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>