44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1165 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1165  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  100 
 
 
362 aa  752    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.786161  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1310  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  90.53 
 
 
356 aa  682    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.504698 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1907  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  75.51 
 
 
358 aa  550  1e-155  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.256678  normal  0.714335 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09201  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  63.85 
 
 
390 aa  496  1e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4340  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  66.18 
 
 
358 aa  492  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0956  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  65.12 
 
 
390 aa  488  1e-137  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10241  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  66.76 
 
 
390 aa  485  1e-136  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0952559  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2261  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  66.37 
 
 
358 aa  481  1e-135  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2312  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  66.37 
 
 
358 aa  481  1e-135  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.39272 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10251  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  64.34 
 
 
390 aa  482  1e-135  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0728  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  63.66 
 
 
358 aa  479  1e-134  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.258691 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3134  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  66.47 
 
 
358 aa  472  1e-132  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4958  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  63.56 
 
 
358 aa  467  9.999999999999999e-131  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2963  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester aerobic oxidative cyclase  63.58 
 
 
358 aa  468  9.999999999999999e-131  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.402608  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2605  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  53.94 
 
 
358 aa  404  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_47501  predicted protein  54.55 
 
 
360 aa  401  9.999999999999999e-111  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.457729  normal  0.356173 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4776  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  53.3 
 
 
358 aa  392  1e-108  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.554063  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3705  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  53.67 
 
 
359 aa  391  1e-108  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3758  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  53.67 
 
 
359 aa  391  1e-108  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.374624  normal  0.835463 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4781  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  49.86 
 
 
355 aa  381  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.724594  normal  0.125106 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3391  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester aerobic oxidative cyclase  51.17 
 
 
358 aa  373  1e-102  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5351  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  50.76 
 
 
364 aa  322  5e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.609865  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4806  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  50.9 
 
 
364 aa  322  6e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0968745 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6407  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  47.95 
 
 
353 aa  322  9.000000000000001e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3971  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  48.74 
 
 
365 aa  319  3.9999999999999996e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.209511  normal  0.408306 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1740  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  47.9 
 
 
365 aa  318  9e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5273  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  49.13 
 
 
364 aa  317  2e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.619471  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1905  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  46.86 
 
 
371 aa  316  4e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.720634  hitchhiker  0.00399105 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1323  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  50.15 
 
 
364 aa  314  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0942361 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3726  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  50.46 
 
 
367 aa  314  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00000205151  hitchhiker  0.00410479 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1541  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  49.21 
 
 
371 aa  313  3.9999999999999997e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00244092 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3728  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  51.63 
 
 
353 aa  310  2e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0231345 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1838  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  49.37 
 
 
362 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.201979 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2032  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  47.23 
 
 
353 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1938  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  47.57 
 
 
363 aa  300  3e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.236638  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0294  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  47.57 
 
 
363 aa  297  2e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.696744  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1000  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  46.93 
 
 
363 aa  296  4e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3544  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  46.35 
 
 
373 aa  296  4e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.829444  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1285  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  46.98 
 
 
375 aa  295  1e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.308511  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0151  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  43.32 
 
 
373 aa  293  3e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0227  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  40.92 
 
 
368 aa  251  1e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  decreased coverage  0.00949985  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08941  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  42.38 
 
 
367 aa  250  2e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.358951  hitchhiker  0.0000747917 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29201  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  43.32 
 
 
349 aa  240  2e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09191  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  41.16 
 
 
349 aa  239  5.999999999999999e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.145742  hitchhiker  0.00000169211 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>