44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_0956 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009091  P9301_10241  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  92.56 
 
 
390 aa  711    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0952559  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0956  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  100 
 
 
390 aa  806    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09201  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  82.31 
 
 
390 aa  652    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10251  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  94.36 
 
 
390 aa  724    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1310  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  68.9 
 
 
356 aa  526  1e-148  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.504698 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1165  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  65.12 
 
 
362 aa  513  1e-144  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.786161  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1907  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  66.76 
 
 
358 aa  504  1e-141  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.256678  normal  0.714335 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4958  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  60.59 
 
 
358 aa  466  9.999999999999999e-131  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0728  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  60.32 
 
 
358 aa  466  9.999999999999999e-131  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.258691 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2963  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester aerobic oxidative cyclase  59.73 
 
 
358 aa  461  1e-129  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.402608  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4340  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  58.18 
 
 
358 aa  456  1e-127  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2312  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  58.13 
 
 
358 aa  445  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.39272 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3134  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  59.52 
 
 
358 aa  445  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2261  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  58.13 
 
 
358 aa  445  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2605  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  50.67 
 
 
358 aa  393  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_47501  predicted protein  50.27 
 
 
360 aa  383  1e-105  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.457729  normal  0.356173 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3758  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  51.34 
 
 
359 aa  379  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.374624  normal  0.835463 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3705  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  51.34 
 
 
359 aa  379  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4776  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  49.18 
 
 
358 aa  376  1e-103  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.554063  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4781  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  47.89 
 
 
355 aa  365  1e-99  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.724594  normal  0.125106 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3391  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester aerobic oxidative cyclase  47.04 
 
 
358 aa  357  1.9999999999999998e-97  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4806  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  43.62 
 
 
364 aa  292  6e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0968745 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6407  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  42.78 
 
 
353 aa  291  1e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3726  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  44.29 
 
 
367 aa  289  7e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00000205151  hitchhiker  0.00410479 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5273  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  42.82 
 
 
364 aa  288  8e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.619471  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5351  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  42.98 
 
 
364 aa  286  5e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.609865  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1905  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  44.08 
 
 
371 aa  285  1.0000000000000001e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.720634  hitchhiker  0.00399105 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3971  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  43.57 
 
 
365 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.209511  normal  0.408306 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3728  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  43.92 
 
 
353 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0231345 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1323  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  41.67 
 
 
364 aa  281  1e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0942361 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1541  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  43.53 
 
 
371 aa  280  2e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00244092 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1740  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  43.21 
 
 
365 aa  281  2e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1285  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  43.79 
 
 
375 aa  280  3e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.308511  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1838  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  42.12 
 
 
362 aa  278  2e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.201979 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2032  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  40.22 
 
 
353 aa  272  6e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1938  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  44.77 
 
 
363 aa  265  8e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.236638  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1000  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  44.44 
 
 
363 aa  261  1e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0151  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  36.5 
 
 
373 aa  260  3e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0294  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  44.12 
 
 
363 aa  259  4e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.696744  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3544  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  42.21 
 
 
373 aa  258  2e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.829444  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08941  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  41.19 
 
 
367 aa  236  4e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.358951  hitchhiker  0.0000747917 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0227  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  41.19 
 
 
368 aa  236  4e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  decreased coverage  0.00949985  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09191  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  38.25 
 
 
349 aa  221  1.9999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.145742  hitchhiker  0.00000169211 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29201  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  40.91 
 
 
349 aa  218  1e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>