44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1740 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1740  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  100 
 
 		 365 aa  752    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3726  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  91.83 
 
 		 367 aa  695    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00000205151  hitchhiker  0.00410479 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3971  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  92.33 
 
 		 365 aa  702    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.209511  normal  0.408306 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1323  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  84.11 
 
 		 364 aa  629  1e-179  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0942361 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6407  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  72.4 
 
 		 353 aa  539  9.999999999999999e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4806  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  67.15 
 
 		 364 aa  484  1e-136  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0968745 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5273  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  66.57 
 
 		 364 aa  478  1e-134  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.619471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5351  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  65.7 
 
 		 364 aa  476  1e-133  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.609865  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1838  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  65.12 
 
 		 362 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.201979 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3728  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  67.15 
 
 		 353 aa  464  9.999999999999999e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0231345 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2032  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  62.5 
 
 		 353 aa  458  9.999999999999999e-129  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1000  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  56.08 
 
 		 363 aa  421  1e-117  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3544  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  58.09 
 
 		 373 aa  424  1e-117  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.829444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1938  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  55.52 
 
 		 363 aa  414  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.236638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0294  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  56.08 
 
 		 363 aa  412  1e-114  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.696744  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0151  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  55.56 
 
 		 373 aa  403  1e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1905  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  55.52 
 
 		 371 aa  333  2e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.720634  hitchhiker  0.00399105 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1541  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  56.23 
 
 		 371 aa  334  2e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00244092 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1285  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  54.74 
 
 		 375 aa  332  6e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.308511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1310  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  49.26 
 
 		 356 aa  322  6e-87  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.504698 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1907  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  49.71 
 
 		 358 aa  321  9.999999999999999e-87  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.256678  normal  0.714335 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4340  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  47.06 
 
 		 358 aa  314  9.999999999999999e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1165  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  48.19 
 
 		 362 aa  312  4.999999999999999e-84  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.786161  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0728  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  47.84 
 
 		 358 aa  310  2.9999999999999997e-83  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.258691 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2963  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester aerobic oxidative cyclase  47.43 
 
 		 358 aa  308  1.0000000000000001e-82  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.402608  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2312  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  47.73 
 
 		 358 aa  308  1.0000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.39272 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2261  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  47.73 
 
 		 358 aa  308  1.0000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3134  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  49.51 
 
 		 358 aa  304  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4958  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  45.8 
 
 		 358 aa  300  2e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_47501  predicted protein  43.28 
 
 		 360 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.457729  normal  0.356173 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3391  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester aerobic oxidative cyclase  44.89 
 
 		 358 aa  275  1.0000000000000001e-72  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09201  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  43.63 
 
 		 390 aa  273  3e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2605  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  42.15 
 
 		 358 aa  273  4.0000000000000004e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0956  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  45.87 
 
 		 390 aa  272  6e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10241  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  43.27 
 
 		 390 aa  272  8.000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0952559  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10251  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  43.79 
 
 		 390 aa  270  2.9999999999999997e-71  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4781  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  43.55 
 
 		 355 aa  268  8.999999999999999e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.724594  normal  0.125106 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4776  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  43.77 
 
 		 358 aa  265  1e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.554063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3705  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  40.62 
 
 		 359 aa  262  6.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3758  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  40.62 
 
 		 359 aa  262  6.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.374624  normal  0.835463 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09191  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  37.76 
 
 		 349 aa  225  8e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.145742  hitchhiker  0.00000169211 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0227  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  39.47 
 
 		 368 aa  222  9e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  decreased coverage  0.00949985  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08941  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  40 
 
 		 367 aa  219  7e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.358951  hitchhiker  0.0000747917 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29201  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase  38.01 
 
 		 349 aa  214  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>