36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1348 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_1348  HEPN domain-containing protein  100 
 
 
118 aa  242  1.9999999999999999e-63  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00624938  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0462  HEPN domain-containing protein  37.07 
 
 
122 aa  94.7  4e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1088  HEPN domain-containing protein  34.78 
 
 
129 aa  92  2e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.942108 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0820  HEPN domain-containing protein  35.34 
 
 
130 aa  74.7  0.0000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.288763 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2161  HEPN domain-containing protein  34.91 
 
 
117 aa  68.6  0.00000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1321  HEPN domain-containing protein  29.57 
 
 
127 aa  63.5  0.0000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.25839  normal  0.430204 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0516  HEPN domain protein  34.83 
 
 
149 aa  60.8  0.000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.184402  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1136  HEPN domain-containing protein  29.27 
 
 
152 aa  56.6  0.0000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.174489 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1045  HEPN domain-containing protein  29.51 
 
 
127 aa  54.3  0.0000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0989  HEPN domain-containing protein  32.5 
 
 
136 aa  51.6  0.000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0639563 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0324  HEPN domain-containing protein  29.06 
 
 
136 aa  51.6  0.000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.33233  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0303  HEPN domain-containing protein  31.11 
 
 
136 aa  50.8  0.000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3921  HEPN domain-containing protein  25.83 
 
 
127 aa  49.7  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.063981 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1364  hypothetical protein  25.27 
 
 
146 aa  47.8  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00320209  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1501  HEPN domain-containing protein  36.67 
 
 
110 aa  47.8  0.00005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000312767 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0717  HEPN domain-containing protein  35.79 
 
 
112 aa  47.8  0.00005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.538375 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1360  hypothetical protein  25.27 
 
 
146 aa  47.8  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.20784  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0085  HEPN domain-containing protein  29.67 
 
 
129 aa  47.4  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.471517  normal  0.275443 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0854  HEPN domain-containing protein  32.58 
 
 
137 aa  46.6  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.949835 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2642  HEPN domain protein  26.67 
 
 
130 aa  46.2  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1393  HEPN domain-containing protein  33.71 
 
 
137 aa  46.2  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0626858  normal  0.751345 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0705  HEPN domain-containing protein  27.73 
 
 
129 aa  44.3  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00674313 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3918  HEPN domain-containing protein  28.09 
 
 
127 aa  43.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.165059  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0316  HEPN domain protein  28.09 
 
 
130 aa  43.5  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3227  HEPN domain-containing protein  29.21 
 
 
127 aa  43.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.082492 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1068  HEPN domain-containing protein  34.04 
 
 
139 aa  43.1  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.803459  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1687  HEPN domain-containing protein  28.89 
 
 
136 aa  42.4  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.0000183339  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0337  HEPN domain protein  27.5 
 
 
129 aa  42  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2456  HEPN domain protein  30.11 
 
 
128 aa  42  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.213966  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3061  amidophosphoribosyltransferase  32.22 
 
 
629 aa  42  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0171  HEPN domain-containing protein  23.58 
 
 
135 aa  41.6  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011774  BCG9842_A0075  HepN domain protein  30.77 
 
 
146 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.535733  normal  0.629451 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1302  HEPN domain-containing protein  23.33 
 
 
136 aa  40.4  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.260484  normal  0.456574 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0040  HEPN domain protein  28.89 
 
 
134 aa  40.4  0.008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0237  HEPN domain-containing protein  28.12 
 
 
131 aa  40.4  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0500  hypothetical protein  38.81 
 
 
109 aa  40  0.01  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>