18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0557 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_0557    100 
 
 		 1054 bp  2089    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.862725  normal  0.0380892 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0587    99.26 
 
 		 845 bp  779    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0543    99.91 
 
 		 1054 bp  2081    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.192224 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3072    93.23 
 
 		 853 bp  470  9.999999999999999e-131  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0548892  normal  0.393847 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1682    93.23 
 
 		 852 bp  470  9.999999999999999e-131  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0527319  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0698    92.92 
 
 		 860 bp  462  1e-127  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0012027 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1807    89.16 
 
 		 842 bp  440  1e-121  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00148619  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1834    87.16 
 
 		 845 bp  391  1e-106  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0087  Transposase-like protein  87.19 
 
 		 815 bp  347  4e-93  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1629  transposase IS4 family protein  86.9 
 
 		 444 bp  238  3e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2436    92.35 
 
 		 264 bp  234  4e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.762859  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2165    94.12 
 
 		 126 bp  180  5e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.154856  normal  0.322351 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2286    93.28 
 
 		 287 bp  172  1e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0461    94.55 
 
 		 180 bp  170  5e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.89255 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0460    88.54 
 
 		 177 bp  103  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.868893 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1981  acetate kinase  91.67 
 
 		 1011 bp  79.8  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.410805 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5841    94.12 
 
 		 384 bp  52  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2231    88.89 
 
 		 772 bp  50.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00103986  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>