18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_1682 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_0698    98.72 
 
 		 860 bp  1624    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0012027 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3072    99.88 
 
 		 853 bp  1675    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0548892  normal  0.393847 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1682    100 
 
 		 852 bp  1689    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0527319  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0587    83.23 
 
 		 845 bp  535  1e-150  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1834    83.18 
 
 		 845 bp  523  1e-146  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0087  Transposase-like protein  83.18 
 
 		 815 bp  523  1e-146  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2436    99.62 
 
 		 264 bp  515  1e-144  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.762859  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0543    93.23 
 
 		 1054 bp  470  9.999999999999999e-131  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.192224 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0557    93.23 
 
 		 1054 bp  470  9.999999999999999e-131  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.862725  normal  0.0380892 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1629  transposase IS4 family protein  96.48 
 
 		 444 bp  442  9.999999999999999e-123  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2286    95.56 
 
 		 287 bp  373  1e-101  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1807    87.47 
 
 		 842 bp  363  5e-98  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00148619  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0461    100 
 
 		 180 bp  357  2.9999999999999997e-96  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.89255 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0460    98.87 
 
 		 177 bp  335  1e-89  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.868893 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2165    99.21 
 
 		 126 bp  242  1e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.154856  normal  0.322351 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1981  acetate kinase  100 
 
 		 1011 bp  119  1.0000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.410805 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2231    93.75 
 
 		 772 bp  48.1  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00103986  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2303  ABC transporter related protein  100 
 
 		 507 bp  48.1  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.184662  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>