18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0698 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_0698    100 
 
 
860 bp  1705    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0012027 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3072    98.61 
 
 
853 bp  1610    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0548892  normal  0.393847 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1682    98.72 
 
 
852 bp  1624    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0527319  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0587    84.11 
 
 
845 bp  585  1.0000000000000001e-165  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1834    84.08 
 
 
845 bp  573  1e-161  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0087  Transposase-like protein  84.08 
 
 
815 bp  573  1e-161  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2436    100 
 
 
264 bp  523  1e-146  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.762859  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1629  transposase IS4 family protein  99.61 
 
 
444 bp  500  1e-139  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1807    82.64 
 
 
842 bp  470  9.999999999999999e-131  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00148619  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0543    92.92 
 
 
1054 bp  462  9.999999999999999e-129  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.192224 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0557    92.92 
 
 
1054 bp  462  9.999999999999999e-129  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.862725  normal  0.0380892 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2286    99.56 
 
 
287 bp  438  1e-120  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0461    100 
 
 
180 bp  355  1e-95  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.89255 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0460    99.44 
 
 
177 bp  343  5e-92  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.868893 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2165    99.21 
 
 
126 bp  242  1e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.154856  normal  0.322351 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1981  acetate kinase  98.55 
 
 
1011 bp  129  1e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.410805 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2231    93.75 
 
 
772 bp  48.1  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00103986  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2303  ABC transporter related protein  100 
 
 
507 bp  48.1  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.184662  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>