13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0460 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_0460    100 
 
 
177 bp  351  4e-95  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.868893 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0698    99.44 
 
 
860 bp  343  1e-92  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0012027 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1629  transposase IS4 family protein  99.44 
 
 
444 bp  343  1e-92  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2436    99.44 
 
 
264 bp  343  1e-92  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.762859  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1682    98.87 
 
 
852 bp  335  2e-90  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0527319  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3072    98.87 
 
 
853 bp  335  2e-90  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0548892  normal  0.393847 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1834    94.55 
 
 
845 bp  170  8e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0087  Transposase-like protein  94.55 
 
 
815 bp  170  8e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0587    86.18 
 
 
845 bp  109  3e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0557    88.54 
 
 
1054 bp  103  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.862725  normal  0.0380892 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1807    87.04 
 
 
842 bp  103  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00148619  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0543    88.54 
 
 
1054 bp  103  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.192224 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2303  ABC transporter related protein  100 
 
 
507 bp  48.1  0.0008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.184662  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>