17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1834 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_0587    86.31 
 
 		 845 bp  753    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1834    100 
 
 		 845 bp  1675    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0087  Transposase-like protein  100 
 
 		 815 bp  1584    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0698    84.08 
 
 		 860 bp  573  1e-161  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0012027 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1682    83.18 
 
 		 852 bp  523  1e-146  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0527319  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3072    83.08 
 
 		 853 bp  509  9.999999999999999e-143  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0548892  normal  0.393847 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1807    82.59 
 
 		 842 bp  502  1e-140  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00148619  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0543    87.16 
 
 		 1054 bp  391  1e-106  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.192224 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0557    87.16 
 
 		 1054 bp  391  1e-106  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.862725  normal  0.0380892 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2436    94.57 
 
 		 264 bp  285  1e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.762859  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1629  transposase IS4 family protein  86.45 
 
 		 444 bp  228  2e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0460    94.55 
 
 		 177 bp  170  4e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.868893 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2165    90.24 
 
 		 126 bp  149  2e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.154856  normal  0.322351 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0461    90.35 
 
 		 180 bp  139  9.999999999999999e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.89255 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2286    84.52 
 
 		 287 bp  117  5e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1981  acetate kinase  91.07 
 
 		 1011 bp  71.9  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.410805 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1016    88 
 
 		 783 bp  52  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.656066  normal  0.559694 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>