15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2165 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_2165    100 
 
 
126 bp  250  7e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.154856  normal  0.322351 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0698    99.21 
 
 
860 bp  242  2e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0012027 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1682    99.21 
 
 
852 bp  242  2e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0527319  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1629  transposase IS4 family protein  98.41 
 
 
444 bp  234  4.0000000000000004e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0461    100 
 
 
180 bp  232  2e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.89255 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3072    98.43 
 
 
853 bp  228  3e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0548892  normal  0.393847 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0587    94.96 
 
 
845 bp  188  2e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0557    94.12 
 
 
1054 bp  180  5.999999999999999e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.862725  normal  0.0380892 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0543    94.12 
 
 
1054 bp  180  5.999999999999999e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.192224 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1807    90.83 
 
 
842 bp  151  5e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00148619  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1834    90.24 
 
 
845 bp  149  2.0000000000000003e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0087  Transposase-like protein  90.24 
 
 
815 bp  149  2.0000000000000003e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1981  acetate kinase  100 
 
 
1011 bp  119  1.9999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.410805 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2286    100 
 
 
287 bp  85.7  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2231    93.75 
 
 
772 bp  48.1  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00103986  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>