14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2286 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_2286    100 
 
 
287 bp  569  1e-160  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0698    99.56 
 
 
860 bp  438  1e-121  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0012027 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1682    95.56 
 
 
852 bp  373  1e-101  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0527319  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3072    95.56 
 
 
853 bp  373  1e-101  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0548892  normal  0.393847 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1981  acetate kinase  98.23 
 
 
1011 bp  208  6e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.410805 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0557    93.28 
 
 
1054 bp  172  3e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.862725  normal  0.0380892 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0587    93.28 
 
 
845 bp  172  3e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0543    93.28 
 
 
1054 bp  172  3e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.192224 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1629  transposase IS4 family protein  100 
 
 
444 bp  131  1.0000000000000001e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1834    84.52 
 
 
845 bp  117  2.0000000000000002e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0087  Transposase-like protein  84.52 
 
 
815 bp  117  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0461    100 
 
 
180 bp  85.7  0.000000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.89255 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2165    100 
 
 
126 bp  85.7  0.000000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.154856  normal  0.322351 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1807    90.7 
 
 
842 bp  54  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00148619  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>