18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0587 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_0557    99.26 
 
 		 1054 bp  779    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.862725  normal  0.0380892 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0587    100 
 
 		 845 bp  1675    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1807    87.66 
 
 		 842 bp  823    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00148619  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1834    86.31 
 
 		 845 bp  753    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0087  Transposase-like protein  86.27 
 
 		 815 bp  710    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0543    99.51 
 
 		 1054 bp  787    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.192224 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0698    84.11 
 
 		 860 bp  585  1.0000000000000001e-165  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0012027 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1682    83.23 
 
 		 852 bp  535  1e-150  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0527319  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3072    83.12 
 
 		 853 bp  521  1.0000000000000001e-145  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0548892  normal  0.393847 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1629  transposase IS4 family protein  87.3 
 
 		 444 bp  246  9e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2436    88.83 
 
 		 264 bp  216  7.999999999999999e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.762859  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2165    94.96 
 
 		 126 bp  188  2.0000000000000003e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.154856  normal  0.322351 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0461    95.45 
 
 		 180 bp  178  1.9999999999999998e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.89255 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2286    93.28 
 
 		 287 bp  172  1e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0460    86.18 
 
 		 177 bp  109  1e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.868893 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1981  acetate kinase  93.33 
 
 		 1011 bp  87.7  0.000000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.410805 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5841    94.12 
 
 		 384 bp  52  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2231    88.89 
 
 		 772 bp  50.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00103986  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>