51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4259 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_4259  hypothetical protein  100 
 
 
88 aa  175  2e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.248279  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3841  hypothetical protein  85.23 
 
 
88 aa  150  7e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.191666  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4377  hypothetical protein  82.95 
 
 
88 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.605573  normal  0.156449 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3805  hypothetical protein  70.73 
 
 
102 aa  121  3e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.105573  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0318  hypothetical protein  76.14 
 
 
88 aa  121  3e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.118234  normal  0.049984 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3822  hypothetical protein  71.26 
 
 
88 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0221  hypothetical protein  71.05 
 
 
102 aa  114  5e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.548895  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0110  hypothetical protein  65.91 
 
 
88 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6387  hypothetical protein  52.38 
 
 
85 aa  81.6  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.857181  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3922  hypothetical protein  50 
 
 
85 aa  80.1  0.000000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0535  hypothetical protein  45.78 
 
 
86 aa  77  0.00000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.254153  normal  0.0144913 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0845  hypothetical protein  48.75 
 
 
85 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2886  hypothetical protein  50.62 
 
 
88 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2419  hypothetical protein  48.86 
 
 
88 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.765292 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5644  hypothetical protein  48.81 
 
 
102 aa  73.6  0.0000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6414  hypothetical protein  51.19 
 
 
146 aa  73.6  0.0000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.184599  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1859  hypothetical protein  50 
 
 
154 aa  73.6  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.513735  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2245  hypothetical protein  50 
 
 
85 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_6973  hypothetical protein  47.62 
 
 
86 aa  71.2  0.000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2038  hypothetical protein  51.9 
 
 
87 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.702942  hitchhiker  0.000879372 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3970  hypothetical protein  46.15 
 
 
125 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.71411 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1874  hypothetical protein  52.44 
 
 
85 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0521  hypothetical protein  51.85 
 
 
87 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5665  hypothetical protein  45.45 
 
 
86 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.45625  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3202  hypothetical protein  50.63 
 
 
81 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0103  hypothetical protein  47.13 
 
 
88 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1583  hypothetical protein  48.1 
 
 
124 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0472662 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2793  hypothetical protein  48.05 
 
 
85 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.445436  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0834  hypothetical protein  47.5 
 
 
94 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.308596  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3204  hypothetical protein  46.25 
 
 
88 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.129438 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7629  hypothetical protein  48.72 
 
 
85 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3973  hypothetical protein  49.38 
 
 
85 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8737  hypothetical protein  40.51 
 
 
85 aa  62  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6413  hypothetical protein  48.72 
 
 
82 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6878  hypothetical protein  41.03 
 
 
205 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6662  hypothetical protein  45.45 
 
 
82 aa  57.8  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2976  hypothetical protein  47.44 
 
 
82 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6106  hypothetical protein  47.44 
 
 
82 aa  57  0.00000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8153  hypothetical protein  46.25 
 
 
146 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0539  hypothetical protein  34.57 
 
 
146 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2043  hypothetical protein  43.75 
 
 
96 aa  54.7  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1170  hypothetical protein  43.42 
 
 
81 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.264773  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6277  hypothetical protein  43.59 
 
 
102 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1382  hypothetical protein  33.33 
 
 
121 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.122145 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5688  hypothetical protein  49.02 
 
 
51 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.676176  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8067  hypothetical protein  48.65 
 
 
55 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.27479  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4725  hypothetical protein  46.43 
 
 
55 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2948  hypothetical protein  40.38 
 
 
159 aa  41.6  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3503  hypothetical protein  62.96 
 
 
97 aa  41.2  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6416  hypothetical protein  32.35 
 
 
107 aa  40.4  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.257533  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4047  hypothetical protein  43.1 
 
 
80 aa  40.4  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.756567  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>