49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_4377 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_4377  hypothetical protein  100 
 
 
88 aa  176  8e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.605573  normal  0.156449 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4259  hypothetical protein  82.95 
 
 
88 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.248279  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3841  hypothetical protein  69.32 
 
 
88 aa  123  8.000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.191666  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0318  hypothetical protein  68.18 
 
 
88 aa  107  5e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.118234  normal  0.049984 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3822  hypothetical protein  63.22 
 
 
88 aa  104  3e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3805  hypothetical protein  60.98 
 
 
102 aa  103  6e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.105573  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0221  hypothetical protein  60.53 
 
 
102 aa  97.1  8e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.548895  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0110  hypothetical protein  57.95 
 
 
88 aa  94.4  5e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3922  hypothetical protein  44.71 
 
 
85 aa  71.6  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6387  hypothetical protein  46.43 
 
 
85 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.857181  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0535  hypothetical protein  42.86 
 
 
86 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.254153  normal  0.0144913 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1859  hypothetical protein  42.86 
 
 
154 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.513735  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2886  hypothetical protein  44.44 
 
 
88 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6414  hypothetical protein  44.83 
 
 
146 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.184599  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0845  hypothetical protein  42.86 
 
 
85 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5644  hypothetical protein  42.86 
 
 
102 aa  64.3  0.0000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3970  hypothetical protein  38.1 
 
 
125 aa  62.8  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.71411 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1874  hypothetical protein  48.24 
 
 
85 aa  62  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3202  hypothetical protein  45 
 
 
81 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2419  hypothetical protein  44.32 
 
 
88 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.765292 
 
 
-
 
NC_010373  M446_6973  hypothetical protein  41.67 
 
 
86 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2245  hypothetical protein  44.05 
 
 
85 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3204  hypothetical protein  46.15 
 
 
88 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.129438 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5665  hypothetical protein  39.77 
 
 
86 aa  60.5  0.000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.45625  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2038  hypothetical protein  42.68 
 
 
87 aa  60.8  0.000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.702942  hitchhiker  0.000879372 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0521  hypothetical protein  46.84 
 
 
87 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2793  hypothetical protein  44.16 
 
 
85 aa  58.2  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.445436  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0103  hypothetical protein  41.38 
 
 
88 aa  57  0.00000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3973  hypothetical protein  45.24 
 
 
85 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1583  hypothetical protein  39.74 
 
 
124 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0472662 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0834  hypothetical protein  42.17 
 
 
94 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.308596  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2043  hypothetical protein  48.28 
 
 
96 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8737  hypothetical protein  36.71 
 
 
85 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6413  hypothetical protein  42.5 
 
 
82 aa  53.5  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7629  hypothetical protein  39.74 
 
 
85 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8153  hypothetical protein  43.04 
 
 
146 aa  50.8  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6662  hypothetical protein  39.24 
 
 
82 aa  50.4  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2976  hypothetical protein  41.25 
 
 
82 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6106  hypothetical protein  41.25 
 
 
82 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6878  hypothetical protein  35.9 
 
 
205 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1170  hypothetical protein  38.75 
 
 
81 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.264773  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0539  hypothetical protein  29.63 
 
 
146 aa  47  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1382  hypothetical protein  32.1 
 
 
121 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.122145 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8067  hypothetical protein  35.29 
 
 
55 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.27479  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5688  hypothetical protein  45.1 
 
 
51 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.676176  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4725  hypothetical protein  53.85 
 
 
55 aa  42  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6277  hypothetical protein  41.03 
 
 
102 aa  40.8  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3503  hypothetical protein  59.26 
 
 
97 aa  40.8  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6416  hypothetical protein  32.56 
 
 
107 aa  40.8  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.257533  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>