42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0539 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_0539  hypothetical protein  100 
 
 
146 aa  290  5e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2886  hypothetical protein  44.19 
 
 
88 aa  78.2  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0834  hypothetical protein  46.99 
 
 
94 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.308596  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8737  hypothetical protein  45.24 
 
 
85 aa  72.8  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_6973  hypothetical protein  42.86 
 
 
86 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6387  hypothetical protein  42.86 
 
 
85 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.857181  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2245  hypothetical protein  42.86 
 
 
85 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7629  hypothetical protein  45.24 
 
 
85 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3922  hypothetical protein  43.37 
 
 
85 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3970  hypothetical protein  39.76 
 
 
125 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.71411 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3202  hypothetical protein  48.15 
 
 
81 aa  67.4  0.00000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1583  hypothetical protein  41.67 
 
 
124 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0472662 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6414  hypothetical protein  35.96 
 
 
146 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.184599  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0845  hypothetical protein  40.48 
 
 
85 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6662  hypothetical protein  48.72 
 
 
82 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0521  hypothetical protein  48.28 
 
 
87 aa  63.9  0.0000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3204  hypothetical protein  41.18 
 
 
88 aa  62  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.129438 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1859  hypothetical protein  38.1 
 
 
154 aa  62  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.513735  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5644  hypothetical protein  38.1 
 
 
102 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6878  hypothetical protein  36.05 
 
 
205 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2038  hypothetical protein  44.83 
 
 
87 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.702942  hitchhiker  0.000879372 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8153  hypothetical protein  41.3 
 
 
146 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2793  hypothetical protein  37.8 
 
 
85 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.445436  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6106  hypothetical protein  46.15 
 
 
82 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2976  hypothetical protein  46.15 
 
 
82 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6413  hypothetical protein  46.15 
 
 
82 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3841  hypothetical protein  38.75 
 
 
88 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.191666  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0535  hypothetical protein  45.78 
 
 
86 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.254153  normal  0.0144913 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4259  hypothetical protein  34.57 
 
 
88 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.248279  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3805  hypothetical protein  34.41 
 
 
102 aa  52  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.105573  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2043  hypothetical protein  44.26 
 
 
96 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3822  hypothetical protein  33.33 
 
 
88 aa  50.4  0.000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4047  hypothetical protein  46.55 
 
 
80 aa  50.4  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.756567  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5688  hypothetical protein  50 
 
 
51 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.676176  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3973  hypothetical protein  44.05 
 
 
85 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4377  hypothetical protein  29.63 
 
 
88 aa  47  0.00008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.605573  normal  0.156449 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1874  hypothetical protein  43.37 
 
 
85 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0221  hypothetical protein  32.89 
 
 
102 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.548895  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4725  hypothetical protein  46.67 
 
 
55 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8604  hypothetical protein  51.16 
 
 
71 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0291564  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0318  hypothetical protein  33.72 
 
 
88 aa  42  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.118234  normal  0.049984 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2419  hypothetical protein  32.1 
 
 
88 aa  40.8  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.765292 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>