51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6387 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_6387  hypothetical protein  100 
 
 
85 aa  169  1e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.857181  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6414  hypothetical protein  83.53 
 
 
146 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.184599  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2245  hypothetical protein  84.52 
 
 
85 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3922  hypothetical protein  81.93 
 
 
85 aa  135  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0845  hypothetical protein  78.57 
 
 
85 aa  131  3e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0834  hypothetical protein  79.27 
 
 
94 aa  130  6e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.308596  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2886  hypothetical protein  69.88 
 
 
88 aa  111  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1583  hypothetical protein  61.9 
 
 
124 aa  106  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0472662 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2043  hypothetical protein  64.37 
 
 
96 aa  103  7e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1859  hypothetical protein  60 
 
 
154 aa  103  8e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.513735  normal 
 
 
-
 
NC_010373  M446_6973  hypothetical protein  60 
 
 
86 aa  100  9e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3970  hypothetical protein  55.95 
 
 
125 aa  99.4  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.71411 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3973  hypothetical protein  63.53 
 
 
85 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6878  hypothetical protein  50.59 
 
 
205 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4259  hypothetical protein  52.38 
 
 
88 aa  81.6  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.248279  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1874  hypothetical protein  57.83 
 
 
85 aa  80.9  0.000000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5688  hypothetical protein  74.51 
 
 
51 aa  80.5  0.000000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.676176  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3822  hypothetical protein  54.76 
 
 
88 aa  78.6  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8153  hypothetical protein  57.65 
 
 
146 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8737  hypothetical protein  48.81 
 
 
85 aa  76.6  0.00000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7629  hypothetical protein  51.76 
 
 
85 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0521  hypothetical protein  50.6 
 
 
87 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0539  hypothetical protein  42.86 
 
 
146 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3202  hypothetical protein  50.62 
 
 
81 aa  71.2  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4377  hypothetical protein  46.43 
 
 
88 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.605573  normal  0.156449 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3469  hypothetical protein  82.61 
 
 
47 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0535  hypothetical protein  48.68 
 
 
86 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.254153  normal  0.0144913 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8067  hypothetical protein  76.92 
 
 
55 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.27479  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0543  hypothetical protein  78 
 
 
50 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3204  hypothetical protein  46.34 
 
 
88 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.129438 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3841  hypothetical protein  46.43 
 
 
88 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.191666  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5644  hypothetical protein  47.06 
 
 
102 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2038  hypothetical protein  46.34 
 
 
87 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.702942  hitchhiker  0.000879372 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2948  hypothetical protein  51.61 
 
 
159 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3805  hypothetical protein  45.45 
 
 
102 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.105573  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4725  hypothetical protein  67.39 
 
 
55 aa  64.3  0.0000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2793  hypothetical protein  42.68 
 
 
85 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.445436  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6413  hypothetical protein  50.65 
 
 
82 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2976  hypothetical protein  50.65 
 
 
82 aa  62  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6106  hypothetical protein  50.65 
 
 
82 aa  62  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0318  hypothetical protein  47.5 
 
 
88 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.118234  normal  0.049984 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0221  hypothetical protein  44 
 
 
102 aa  62  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.548895  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0110  hypothetical protein  45.45 
 
 
88 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6662  hypothetical protein  50 
 
 
82 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3503  hypothetical protein  78.79 
 
 
97 aa  60.5  0.000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4047  hypothetical protein  53.23 
 
 
80 aa  60.1  0.000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.756567  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3509  hypothetical protein  76.92 
 
 
73 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5665  hypothetical protein  41.25 
 
 
86 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.45625  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6416  hypothetical protein  33.33 
 
 
107 aa  42.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.257533  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0103  hypothetical protein  40.48 
 
 
88 aa  42.4  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2419  hypothetical protein  39.24 
 
 
88 aa  42  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.765292 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>