43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3805 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_3805  hypothetical protein  100 
 
 
102 aa  205  2e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.105573  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0221  hypothetical protein  98.04 
 
 
102 aa  202  9e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.548895  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4259  hypothetical protein  70.73 
 
 
88 aa  121  3e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.248279  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3841  hypothetical protein  64.63 
 
 
88 aa  110  7.000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.191666  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4377  hypothetical protein  60.98 
 
 
88 aa  103  6e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.605573  normal  0.156449 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3822  hypothetical protein  58.02 
 
 
88 aa  92  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0318  hypothetical protein  60.98 
 
 
88 aa  84  7e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.118234  normal  0.049984 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0110  hypothetical protein  53.01 
 
 
88 aa  82.8  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2886  hypothetical protein  46.84 
 
 
88 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6387  hypothetical protein  45.45 
 
 
85 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.857181  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0535  hypothetical protein  40.26 
 
 
86 aa  64.3  0.0000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.254153  normal  0.0144913 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3922  hypothetical protein  43.59 
 
 
85 aa  63.9  0.0000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5644  hypothetical protein  42.17 
 
 
102 aa  62  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0845  hypothetical protein  43.59 
 
 
85 aa  62  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2793  hypothetical protein  42.86 
 
 
85 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.445436  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6414  hypothetical protein  44.58 
 
 
146 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.184599  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2245  hypothetical protein  44.58 
 
 
85 aa  60.8  0.000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_6973  hypothetical protein  40.96 
 
 
86 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1859  hypothetical protein  40.51 
 
 
154 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.513735  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1583  hypothetical protein  42.86 
 
 
124 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0472662 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3204  hypothetical protein  41.56 
 
 
88 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.129438 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3202  hypothetical protein  47.44 
 
 
81 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3970  hypothetical protein  37.5 
 
 
125 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.71411 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6413  hypothetical protein  48.1 
 
 
82 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0834  hypothetical protein  41.57 
 
 
94 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.308596  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2038  hypothetical protein  41.03 
 
 
87 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.702942  hitchhiker  0.000879372 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0521  hypothetical protein  44.87 
 
 
87 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6106  hypothetical protein  46.84 
 
 
82 aa  53.9  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0539  hypothetical protein  34.41 
 
 
146 aa  52  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7629  hypothetical protein  39.76 
 
 
85 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8737  hypothetical protein  37.18 
 
 
85 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2976  hypothetical protein  46.15 
 
 
82 aa  52  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1874  hypothetical protein  43.59 
 
 
85 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2043  hypothetical protein  39.66 
 
 
96 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8153  hypothetical protein  39.74 
 
 
146 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5665  hypothetical protein  39.02 
 
 
86 aa  47.8  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.45625  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6662  hypothetical protein  40.51 
 
 
82 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6878  hypothetical protein  33.33 
 
 
205 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3973  hypothetical protein  41.03 
 
 
85 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6277  hypothetical protein  36.46 
 
 
102 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2419  hypothetical protein  36.59 
 
 
88 aa  43.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.765292 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6416  hypothetical protein  32.14 
 
 
107 aa  42.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.257533  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5688  hypothetical protein  41.18 
 
 
51 aa  42  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.676176  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>