43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2043 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_2043  hypothetical protein  100 
 
 
96 aa  195  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6414  hypothetical protein  67.82 
 
 
146 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.184599  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3922  hypothetical protein  78.79 
 
 
85 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6387  hypothetical protein  64.37 
 
 
85 aa  103  7e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.857181  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0834  hypothetical protein  62.96 
 
 
94 aa  99.4  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.308596  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0845  hypothetical protein  60.49 
 
 
85 aa  98.2  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2245  hypothetical protein  62.96 
 
 
85 aa  95.9  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2886  hypothetical protein  55.7 
 
 
88 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1583  hypothetical protein  53.09 
 
 
124 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0472662 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5688  hypothetical protein  72.55 
 
 
51 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.676176  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1859  hypothetical protein  48.15 
 
 
154 aa  77  0.00000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.513735  normal 
 
 
-
 
NC_010373  M446_6973  hypothetical protein  57.58 
 
 
86 aa  77  0.00000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3970  hypothetical protein  48.1 
 
 
125 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.71411 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2948  hypothetical protein  53.85 
 
 
159 aa  73.6  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6878  hypothetical protein  55 
 
 
205 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8067  hypothetical protein  74.36 
 
 
55 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.27479  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3973  hypothetical protein  65.57 
 
 
85 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1874  hypothetical protein  60 
 
 
85 aa  64.7  0.0000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3503  hypothetical protein  84.38 
 
 
97 aa  62  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8153  hypothetical protein  56.06 
 
 
146 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4725  hypothetical protein  64.44 
 
 
55 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3204  hypothetical protein  51.67 
 
 
88 aa  57.4  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.129438 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4377  hypothetical protein  48.28 
 
 
88 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.605573  normal  0.156449 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0535  hypothetical protein  50 
 
 
86 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.254153  normal  0.0144913 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2793  hypothetical protein  45 
 
 
85 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.445436  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4259  hypothetical protein  43.75 
 
 
88 aa  54.7  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.248279  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3202  hypothetical protein  42.11 
 
 
81 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0521  hypothetical protein  42.11 
 
 
87 aa  53.9  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0539  hypothetical protein  44.26 
 
 
146 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8737  hypothetical protein  44.62 
 
 
85 aa  50.8  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3822  hypothetical protein  42.62 
 
 
88 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3469  hypothetical protein  77.42 
 
 
47 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2038  hypothetical protein  45.61 
 
 
87 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.702942  hitchhiker  0.000879372 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0543  hypothetical protein  74.19 
 
 
50 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3805  hypothetical protein  39.66 
 
 
102 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.105573  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0221  hypothetical protein  39.66 
 
 
102 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.548895  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7629  hypothetical protein  40 
 
 
85 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3509  hypothetical protein  80.77 
 
 
73 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3841  hypothetical protein  38.33 
 
 
88 aa  47  0.00008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.191666  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6662  hypothetical protein  54.76 
 
 
82 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5644  hypothetical protein  45.1 
 
 
102 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0318  hypothetical protein  39.47 
 
 
88 aa  41.2  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.118234  normal  0.049984 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6413  hypothetical protein  50 
 
 
82 aa  40.4  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>