47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_3822 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_3822  hypothetical protein  100 
 
 
88 aa  175  2e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4259  hypothetical protein  71.26 
 
 
88 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.248279  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0110  hypothetical protein  67.82 
 
 
88 aa  116  9e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0318  hypothetical protein  77.01 
 
 
88 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.118234  normal  0.049984 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4377  hypothetical protein  63.22 
 
 
88 aa  104  3e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.605573  normal  0.156449 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3841  hypothetical protein  62.07 
 
 
88 aa  102  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.191666  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3805  hypothetical protein  58.02 
 
 
102 aa  92  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.105573  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0221  hypothetical protein  57.89 
 
 
102 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.548895  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3922  hypothetical protein  54.12 
 
 
85 aa  83.6  7e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2245  hypothetical protein  55.95 
 
 
85 aa  80.5  0.000000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6387  hypothetical protein  54.76 
 
 
85 aa  78.6  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.857181  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0535  hypothetical protein  46.75 
 
 
86 aa  78.2  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.254153  normal  0.0144913 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0845  hypothetical protein  51.19 
 
 
85 aa  74.7  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2886  hypothetical protein  53.09 
 
 
88 aa  74.3  0.0000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6414  hypothetical protein  50.57 
 
 
146 aa  72.8  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.184599  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3204  hypothetical protein  45.57 
 
 
88 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.129438 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5644  hypothetical protein  47.62 
 
 
102 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2419  hypothetical protein  43.68 
 
 
88 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.765292 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2038  hypothetical protein  48.1 
 
 
87 aa  67.4  0.00000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.702942  hitchhiker  0.000879372 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2793  hypothetical protein  46.99 
 
 
85 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.445436  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0521  hypothetical protein  48.1 
 
 
87 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0834  hypothetical protein  49.37 
 
 
94 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.308596  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0103  hypothetical protein  45.56 
 
 
88 aa  64.3  0.0000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1874  hypothetical protein  49.38 
 
 
85 aa  62  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1859  hypothetical protein  45.24 
 
 
154 aa  60.8  0.000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.513735  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8153  hypothetical protein  43.21 
 
 
146 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1583  hypothetical protein  45.57 
 
 
124 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0472662 
 
 
-
 
NC_010373  M446_6973  hypothetical protein  43.21 
 
 
86 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3973  hypothetical protein  47.5 
 
 
85 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6413  hypothetical protein  47.44 
 
 
82 aa  57  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3970  hypothetical protein  39.51 
 
 
125 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.71411 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3202  hypothetical protein  44.3 
 
 
81 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5665  hypothetical protein  40.23 
 
 
86 aa  55.1  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.45625  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7629  hypothetical protein  43.59 
 
 
85 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2976  hypothetical protein  46.15 
 
 
82 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6106  hypothetical protein  46.15 
 
 
82 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8737  hypothetical protein  37.97 
 
 
85 aa  52  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2043  hypothetical protein  42.62 
 
 
96 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0539  hypothetical protein  33.33 
 
 
146 aa  50.4  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6878  hypothetical protein  37.18 
 
 
205 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0543  hypothetical protein  55.1 
 
 
50 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6662  hypothetical protein  41.56 
 
 
82 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4047  hypothetical protein  43.86 
 
 
80 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.756567  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1170  hypothetical protein  38.75 
 
 
81 aa  43.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.264773  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5688  hypothetical protein  43.14 
 
 
51 aa  42.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.676176  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8067  hypothetical protein  36.54 
 
 
55 aa  42.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.27479  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2948  hypothetical protein  40.38 
 
 
159 aa  42  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>