53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3973 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_3973  hypothetical protein  100 
 
 
85 aa  165  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1874  hypothetical protein  84.34 
 
 
85 aa  124  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0845  hypothetical protein  60.71 
 
 
85 aa  98.2  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6387  hypothetical protein  63.53 
 
 
85 aa  98.2  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.857181  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3922  hypothetical protein  59.04 
 
 
85 aa  94  7e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6414  hypothetical protein  58.82 
 
 
146 aa  92.8  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.184599  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2245  hypothetical protein  58.33 
 
 
85 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2886  hypothetical protein  56.63 
 
 
88 aa  88.2  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0834  hypothetical protein  58.54 
 
 
94 aa  87  7e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.308596  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0521  hypothetical protein  58.54 
 
 
87 aa  83.6  9e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2043  hypothetical protein  65.57 
 
 
96 aa  80.5  0.000000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8737  hypothetical protein  47.62 
 
 
85 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4259  hypothetical protein  49.38 
 
 
88 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.248279  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3970  hypothetical protein  49.4 
 
 
125 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.71411 
 
 
-
 
NC_010373  M446_6973  hypothetical protein  50.59 
 
 
86 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5644  hypothetical protein  49.41 
 
 
102 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7629  hypothetical protein  47.06 
 
 
85 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1583  hypothetical protein  51.19 
 
 
124 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0472662 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2038  hypothetical protein  52.44 
 
 
87 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.702942  hitchhiker  0.000879372 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8153  hypothetical protein  55.29 
 
 
146 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1859  hypothetical protein  48.24 
 
 
154 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.513735  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4377  hypothetical protein  45.24 
 
 
88 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.605573  normal  0.156449 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2793  hypothetical protein  45.12 
 
 
85 aa  67.8  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.445436  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3822  hypothetical protein  47.5 
 
 
88 aa  67  0.00000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3204  hypothetical protein  45.12 
 
 
88 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.129438 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3841  hypothetical protein  46.25 
 
 
88 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.191666  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3202  hypothetical protein  46.91 
 
 
81 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2948  hypothetical protein  60 
 
 
159 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0539  hypothetical protein  44.05 
 
 
146 aa  63.5  0.0000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8067  hypothetical protein  52.73 
 
 
55 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.27479  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0535  hypothetical protein  45.45 
 
 
86 aa  60.8  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.254153  normal  0.0144913 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6878  hypothetical protein  43.75 
 
 
205 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5688  hypothetical protein  62.22 
 
 
51 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.676176  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3805  hypothetical protein  41.03 
 
 
102 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.105573  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4725  hypothetical protein  68.42 
 
 
55 aa  57  0.00000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0318  hypothetical protein  47.5 
 
 
88 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.118234  normal  0.049984 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0221  hypothetical protein  40 
 
 
102 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.548895  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6662  hypothetical protein  47.44 
 
 
82 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0110  hypothetical protein  42.31 
 
 
88 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4047  hypothetical protein  53.57 
 
 
80 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.756567  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3503  hypothetical protein  63.64 
 
 
97 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2976  hypothetical protein  42.31 
 
 
82 aa  43.5  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6413  hypothetical protein  42.31 
 
 
82 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6106  hypothetical protein  42.31 
 
 
82 aa  43.5  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4849  hypothetical protein  54.05 
 
 
244 aa  41.6  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.616836  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8604  hypothetical protein  36.25 
 
 
71 aa  41.2  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0291564  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3766  hypothetical protein  50 
 
 
228 aa  41.2  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3469  hypothetical protein  55.56 
 
 
47 aa  40.8  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5665  hypothetical protein  37.8 
 
 
86 aa  40.8  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.45625  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0543  hypothetical protein  52 
 
 
50 aa  40.4  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2419  hypothetical protein  40.48 
 
 
88 aa  40.4  0.009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.765292 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0103  hypothetical protein  41.77 
 
 
88 aa  40  0.01  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3509  hypothetical protein  59.26 
 
 
73 aa  40  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>