38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1638 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1638  putative cobalamin biosyntheis protein M  100 
 
 		 215 aa  421  1e-117  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.092497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1929  ABC-type Co2+ transport system permease component-like protein  28.08 
 
 		 259 aa  72.8  0.000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.88224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2184  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  28.96 
 
 		 241 aa  63.2  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00256059 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1702  cobalamin biosynthesis protein CbiM  28.24 
 
 		 231 aa  55.1  0.0000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.254913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1739  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  28.7 
 
 		 204 aa  54.7  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.749284  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1044  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  28.31 
 
 		 246 aa  53.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.116161 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3500  cobalt transport protein CbiM  27.68 
 
 		 211 aa  53.1  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1085  hypothetical protein  24.66 
 
 		 231 aa  51.6  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0531  cobalt transport protein CbiM  26.39 
 
 		 230 aa  51.6  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3205  cobalt transport protein CbiM  25.11 
 
 		 229 aa  50.8  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3808  cobalt transport protein CbiM  24.54 
 
 		 245 aa  50.1  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0743  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  26.29 
 
 		 241 aa  48.5  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0772  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  26.29 
 
 		 241 aa  48.5  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0519153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2565  cobalt transport protein CbiM  24.68 
 
 		 239 aa  48.5  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.779557  normal  0.114693 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2291  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  28.9 
 
 		 235 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.372139 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2022  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  25.23 
 
 		 197 aa  48.1  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000920884  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1266  cobalamin biosynthesis protein CbiM  25.48 
 
 		 248 aa  47  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1293  cobalamin biosynthesis protein CbiM  24.88 
 
 		 232 aa  47  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.0034572  normal  0.0275766 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4182  cobalt transport protein CbiM  25.35 
 
 		 251 aa  46.6  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1057  cobalt transport protein CbiM  23.38 
 
 		 330 aa  45.8  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3892  cobalt transport protein CbiM  23.5 
 
 		 256 aa  45.4  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.885543 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0543  cobalt transport protein CbiM  26.61 
 
 		 193 aa  45.4  0.0007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0031  cobalt transport protein CbiM  23.72 
 
 		 212 aa  45.1  0.0007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1148  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  34.35 
 
 		 218 aa  45.1  0.0008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00870535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1351  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  29.86 
 
 		 233 aa  45.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.309906  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3004  cobalt transport protein CbiM  24.54 
 
 		 321 aa  44.7  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0882  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  27.88 
 
 		 421 aa  44.7  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4360  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  25.79 
 
 		 328 aa  44.3  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1767  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  25.97 
 
 		 219 aa  42.7  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.113369  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0323  cobalt transport protein CbiM  25.76 
 
 		 249 aa  42.7  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00019504  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2145  cobalt transport protein CbiM  28.12 
 
 		 235 aa  42.7  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0808457  normal  0.37009 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2474  cobalt transport protein CbiM  26.19 
 
 		 201 aa  42  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0090  cobalt transport protein CbiM  25 
 
 		 210 aa  42.4  0.006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1959  cobalt transport protein CbiM  23.66 
 
 		 226 aa  42  0.008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0790  cobalt transport protein CbiM  23.42 
 
 		 225 aa  42  0.008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0163  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  29.2 
 
 		 310 aa  41.6  0.009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.118647  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0146  cobalt transport protein CbiM  22.55 
 
 		 221 aa  41.6  0.01  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0185688  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5179  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  33.67 
 
 		 229 aa  41.6  0.01  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>