18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0947 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_0947  Protein of unknown function DUF63  100 
 
 
281 aa  555  1e-157  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2044  hypothetical protein  61.57 
 
 
281 aa  360  2e-98  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1137  hypothetical protein  59.43 
 
 
281 aa  333  1e-90  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.615584 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1961  hypothetical protein  54.86 
 
 
288 aa  330  2e-89  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.987254 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1309  SMC domain-containing protein  47.17 
 
 
278 aa  207  1e-52  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0290  hypothetical protein  35.82 
 
 
285 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.51391  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1031  hypothetical protein  35.89 
 
 
283 aa  161  1e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1165  hypothetical protein  31.3 
 
 
273 aa  101  1e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.249015  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0016  hypothetical protein  30.71 
 
 
272 aa  93.6  3e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1178  Protein of unknown function DUF63  25.35 
 
 
384 aa  93.6  3e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.000653085 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1345  hypothetical protein  28.32 
 
 
268 aa  83.2  0.000000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1339  hypothetical protein  27.43 
 
 
268 aa  83.2  0.000000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0623  hypothetical protein  28.47 
 
 
268 aa  80.1  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.532629  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1330  hypothetical protein  28.83 
 
 
268 aa  79  0.00000000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.394918  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2950  Protein of unknown function DUF63  27.4 
 
 
383 aa  76.6  0.0000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.153375  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2221  Protein of unknown function DUF63  27.59 
 
 
388 aa  75.1  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.583411 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0688  Protein of unknown function DUF63  27.12 
 
 
375 aa  71.2  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.216343  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2075  Protein of unknown function DUF63  23.11 
 
 
374 aa  61.2  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>