17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1345 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1345  hypothetical protein  100 
 
 
268 aa  529  1e-149  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0623  hypothetical protein  95.52 
 
 
268 aa  499  1e-140  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.532629  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1330  hypothetical protein  95.9 
 
 
268 aa  499  1e-140  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.394918  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1339  hypothetical protein  77.61 
 
 
268 aa  438  9.999999999999999e-123  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0016  hypothetical protein  57.14 
 
 
272 aa  292  4e-78  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0290  hypothetical protein  29.33 
 
 
285 aa  103  3e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.51391  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1031  hypothetical protein  28.21 
 
 
283 aa  101  1e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2044  hypothetical protein  29.37 
 
 
281 aa  94  3e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1137  hypothetical protein  29.08 
 
 
281 aa  92  9e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.615584 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1165  hypothetical protein  28.52 
 
 
273 aa  89.7  4e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.249015  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1961  hypothetical protein  26.64 
 
 
288 aa  82.8  0.000000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.987254 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0947  Protein of unknown function DUF63  28.11 
 
 
281 aa  73.2  0.000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1309  SMC domain-containing protein  27.48 
 
 
278 aa  68.2  0.0000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1178  Protein of unknown function DUF63  22.22 
 
 
384 aa  47.4  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.000653085 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1525  Protein of unknown function DUF63  25.83 
 
 
277 aa  46.2  0.0005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2075  Protein of unknown function DUF63  28.35 
 
 
374 aa  45.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0688  Protein of unknown function DUF63  29.82 
 
 
375 aa  43.9  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.216343  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>