19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_2044 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_2044  hypothetical protein  100 
 
 
281 aa  546  1e-154  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0947  Protein of unknown function DUF63  61.57 
 
 
281 aa  333  2e-90  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1137  hypothetical protein  60.14 
 
 
281 aa  332  4e-90  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.615584 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1961  hypothetical protein  49.65 
 
 
288 aa  288  6e-77  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.987254 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1309  SMC domain-containing protein  47.58 
 
 
278 aa  204  2e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0290  hypothetical protein  31.91 
 
 
285 aa  144  2e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.51391  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1031  hypothetical protein  34.16 
 
 
283 aa  138  1e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1165  hypothetical protein  35.48 
 
 
273 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.249015  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0016  hypothetical protein  28.67 
 
 
272 aa  101  2e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1339  hypothetical protein  27.82 
 
 
268 aa  99.4  6e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1345  hypothetical protein  29.37 
 
 
268 aa  94  3e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1178  Protein of unknown function DUF63  28.04 
 
 
384 aa  88.6  1e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.000653085 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0623  hypothetical protein  29.23 
 
 
268 aa  85.5  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.532629  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1330  hypothetical protein  29.23 
 
 
268 aa  83.6  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.394918  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0688  Protein of unknown function DUF63  28.24 
 
 
375 aa  72.8  0.000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.216343  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2221  Protein of unknown function DUF63  26.1 
 
 
388 aa  68.9  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.583411 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2950  Protein of unknown function DUF63  27.7 
 
 
383 aa  66.6  0.0000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.153375  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2075  Protein of unknown function DUF63  24.74 
 
 
374 aa  58.5  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0570  Protein of unknown function DUF63  27 
 
 
273 aa  50.8  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>