26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4739 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_4739  protein of unknown function DUF1150  100 
 
 		 83 aa  166  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0438288  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4229  hypothetical protein  87.95 
 
 		 83 aa  152  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.611676  hitchhiker  0.00805122 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0055  protein of unknown function DUF1150  67.07 
 
 		 88 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.308116  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0181  hypothetical protein  66.25 
 
 		 88 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.489602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0116  hypothetical protein  64.37 
 
 		 87 aa  115  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.833113 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1903  protein of unknown function DUF1150  64.63 
 
 		 93 aa  114  5e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.557763 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1621  hypothetical protein  64.63 
 
 		 93 aa  114  5e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00907328 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0410  hypothetical protein  66.25 
 
 		 87 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1615  protein of unknown function DUF1150  68.42 
 
 		 98 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0149987  hitchhiker  0.0025404 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0652  hypothetical protein  64.56 
 
 		 88 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0507627 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3161  hypothetical protein  71.83 
 
 		 94 aa  111  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.243875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0212  hypothetical protein  60.98 
 
 		 88 aa  107  5e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0168  hypothetical protein  60.23 
 
 		 88 aa  107  7.000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2033  hypothetical protein  55.29 
 
 		 89 aa  97.4  5e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0513  hypothetical protein  60.98 
 
 		 88 aa  97.1  7e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1373  protein of unknown function DUF1150  57.89 
 
 		 88 aa  95.5  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.620399 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3664  hypothetical protein  50 
 
 		 85 aa  84.7  4e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.805685  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0048  hypothetical protein  48.05 
 
 		 85 aa  80.1  0.000000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.725012  hitchhiker  0.0000000457362 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0011  protein of unknown function DUF1150  46.05 
 
 		 85 aa  76.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0617045  normal  0.0877122 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0011  protein of unknown function DUF1150  44.74 
 
 		 85 aa  74.7  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000282298 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0156  hypothetical protein  46.48 
 
 		 81 aa  72.8  0.000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.147687  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0162  hypothetical protein  46.48 
 
 		 81 aa  72.8  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0173  hypothetical protein  47.89 
 
 		 81 aa  72  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.441398  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0446  hypothetical protein  43.42 
 
 		 85 aa  70.1  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4962  hypothetical protein  35.9 
 
 		 90 aa  49.7  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.780317  normal  0.980249 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0189  hypothetical protein  32.5 
 
 		 99 aa  42.4  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.577781  normal  0.409086 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>