26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0055 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_0055  protein of unknown function DUF1150  100 
 
 		 88 aa  179  8.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.308116  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0181  hypothetical protein  92.05 
 
 		 88 aa  167  6e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.489602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0652  hypothetical protein  88.64 
 
 		 88 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0507627 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0410  hypothetical protein  93.67 
 
 		 87 aa  151  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0116  hypothetical protein  93.42 
 
 		 87 aa  146  9e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.833113 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0212  hypothetical protein  76.14 
 
 		 88 aa  137  6e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0168  hypothetical protein  76.14 
 
 		 88 aa  137  6e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4739  protein of unknown function DUF1150  67.07 
 
 		 83 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0438288  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2033  hypothetical protein  75 
 
 		 89 aa  117  7e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4229  hypothetical protein  64.63 
 
 		 83 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.611676  hitchhiker  0.00805122 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0513  hypothetical protein  60.23 
 
 		 88 aa  108  2.0000000000000002e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1621  hypothetical protein  58.06 
 
 		 93 aa  103  9e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00907328 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1903  protein of unknown function DUF1150  58.06 
 
 		 93 aa  103  9e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.557763 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1615  protein of unknown function DUF1150  62.34 
 
 		 98 aa  100  7e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0149987  hitchhiker  0.0025404 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3161  hypothetical protein  64.79 
 
 		 94 aa  95.9  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.243875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1373  protein of unknown function DUF1150  54.02 
 
 		 88 aa  92.8  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.620399 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0048  hypothetical protein  48.68 
 
 		 85 aa  86.3  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.725012  hitchhiker  0.0000000457362 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0011  protein of unknown function DUF1150  47.37 
 
 		 85 aa  84.3  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0617045  normal  0.0877122 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0011  protein of unknown function DUF1150  46.05 
 
 		 85 aa  82.8  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000282298 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0446  hypothetical protein  47.37 
 
 		 85 aa  81.3  0.000000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0162  hypothetical protein  51.32 
 
 		 81 aa  79.3  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0156  hypothetical protein  51.32 
 
 		 81 aa  79.3  0.00000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.147687  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3664  hypothetical protein  44.32 
 
 		 85 aa  79.7  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.805685  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0173  hypothetical protein  49.33 
 
 		 81 aa  75.9  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.441398  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0189  hypothetical protein  31.58 
 
 		 99 aa  52  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.577781  normal  0.409086 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4962  hypothetical protein  34.62 
 
 		 90 aa  43.5  0.0009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.780317  normal  0.980249 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>