27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0116 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0116  hypothetical protein  100 
 
 		 87 aa  178  2.9999999999999997e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.833113 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0410  hypothetical protein  88.51 
 
 		 87 aa  157  5e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0181  hypothetical protein  92.21 
 
 		 88 aa  149  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.489602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0055  protein of unknown function DUF1150  93.42 
 
 		 88 aa  146  9e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.308116  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0652  hypothetical protein  86.08 
 
 		 88 aa  144  3e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0507627 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0212  hypothetical protein  88.16 
 
 		 88 aa  139  9.999999999999999e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0168  hypothetical protein  86.84 
 
 		 88 aa  137  3.9999999999999997e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2033  hypothetical protein  74.36 
 
 		 89 aa  121  3e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4739  protein of unknown function DUF1150  64.37 
 
 		 83 aa  115  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0438288  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4229  hypothetical protein  67.11 
 
 		 83 aa  110  5e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.611676  hitchhiker  0.00805122 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0513  hypothetical protein  56.32 
 
 		 88 aa  103  1e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1621  hypothetical protein  55.95 
 
 		 93 aa  101  3e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00907328 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1903  protein of unknown function DUF1150  55.95 
 
 		 93 aa  101  3e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.557763 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1615  protein of unknown function DUF1150  61.84 
 
 		 98 aa  100  6e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0149987  hitchhiker  0.0025404 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3161  hypothetical protein  63.38 
 
 		 94 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.243875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1373  protein of unknown function DUF1150  55.84 
 
 		 88 aa  92.4  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.620399 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0048  hypothetical protein  45.68 
 
 		 85 aa  81.3  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.725012  hitchhiker  0.0000000457362 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0011  protein of unknown function DUF1150  44.87 
 
 		 85 aa  79  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0617045  normal  0.0877122 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0446  hypothetical protein  47.44 
 
 		 85 aa  79.3  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3664  hypothetical protein  42.86 
 
 		 85 aa  77.8  0.00000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.805685  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0162  hypothetical protein  53.52 
 
 		 81 aa  77.4  0.00000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0156  hypothetical protein  53.52 
 
 		 81 aa  77.4  0.00000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.147687  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0011  protein of unknown function DUF1150  43.59 
 
 		 85 aa  77.4  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000282298 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0173  hypothetical protein  50.7 
 
 		 81 aa  73.9  0.0000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.441398  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0189  hypothetical protein  31.17 
 
 		 99 aa  52  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.577781  normal  0.409086 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4962  hypothetical protein  36.25 
 
 		 90 aa  45.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.780317  normal  0.980249 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0340  hypothetical protein  35.21 
 
 		 87 aa  40.4  0.008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.00558652  normal  0.108627 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>