25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0048 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0048  hypothetical protein  100 
 
 		 85 aa  177  5.999999999999999e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.725012  hitchhiker  0.0000000457362 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0011  protein of unknown function DUF1150  72.94 
 
 		 85 aa  141  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0617045  normal  0.0877122 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0446  hypothetical protein  76.47 
 
 		 85 aa  140  4e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0011  protein of unknown function DUF1150  71.76 
 
 		 85 aa  138  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000282298 
 
 
-
 
NC_004310  BR0162  hypothetical protein  50.63 
 
 		 81 aa  95.5  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0156  hypothetical protein  50.63 
 
 		 81 aa  95.5  2e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.147687  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0173  hypothetical protein  52.63 
 
 		 81 aa  94  7e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.441398  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0652  hypothetical protein  48.24 
 
 		 88 aa  90.1  8e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0507627 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0513  hypothetical protein  50 
 
 		 88 aa  87.4  6e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1373  protein of unknown function DUF1150  51.95 
 
 		 88 aa  86.7  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.620399 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0055  protein of unknown function DUF1150  48.68 
 
 		 88 aa  86.3  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.308116  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0212  hypothetical protein  48.05 
 
 		 88 aa  85.5  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3161  hypothetical protein  52.78 
 
 		 94 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.243875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0181  hypothetical protein  43.53 
 
 		 88 aa  85.5  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.489602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0168  hypothetical protein  49.35 
 
 		 88 aa  85.1  3e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2033  hypothetical protein  47.37 
 
 		 89 aa  84  6e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1615  protein of unknown function DUF1150  48.05 
 
 		 98 aa  81.6  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0149987  hitchhiker  0.0025404 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0410  hypothetical protein  47.37 
 
 		 87 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0116  hypothetical protein  45.68 
 
 		 87 aa  81.3  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.833113 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1621  hypothetical protein  48.05 
 
 		 93 aa  80.9  0.000000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00907328 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1903  protein of unknown function DUF1150  48.05 
 
 		 93 aa  80.9  0.000000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.557763 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3664  hypothetical protein  44.3 
 
 		 85 aa  80.9  0.000000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.805685  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4739  protein of unknown function DUF1150  48.05 
 
 		 83 aa  80.1  0.000000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0438288  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4229  hypothetical protein  47.89 
 
 		 83 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.611676  hitchhiker  0.00805122 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2206  hypothetical protein  35.9 
 
 		 75 aa  42  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>