26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1621 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_1903  protein of unknown function DUF1150  100 
 
 		 93 aa  186  1e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.557763 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1621  hypothetical protein  100 
 
 		 93 aa  186  1e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00907328 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1615  protein of unknown function DUF1150  97.44 
 
 		 98 aa  155  2e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0149987  hitchhiker  0.0025404 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3161  hypothetical protein  79.01 
 
 		 94 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.243875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4229  hypothetical protein  70.73 
 
 		 83 aa  122  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.611676  hitchhiker  0.00805122 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4739  protein of unknown function DUF1150  64.63 
 
 		 83 aa  114  5e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0438288  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0055  protein of unknown function DUF1150  58.06 
 
 		 88 aa  103  9e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.308116  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2033  hypothetical protein  60.71 
 
 		 89 aa  102  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0116  hypothetical protein  55.95 
 
 		 87 aa  101  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.833113 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0181  hypothetical protein  62.03 
 
 		 88 aa  100  8e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.489602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0652  hypothetical protein  60.76 
 
 		 88 aa  99.8  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0507627 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0410  hypothetical protein  55.95 
 
 		 87 aa  98.6  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0513  hypothetical protein  56.1 
 
 		 88 aa  97.1  7e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0212  hypothetical protein  54.76 
 
 		 88 aa  92.4  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0168  hypothetical protein  61.97 
 
 		 88 aa  92  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1373  protein of unknown function DUF1150  59.72 
 
 		 88 aa  89.7  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.620399 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3664  hypothetical protein  52.78 
 
 		 85 aa  82  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.805685  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0048  hypothetical protein  48.05 
 
 		 85 aa  80.9  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.725012  hitchhiker  0.0000000457362 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0156  hypothetical protein  55.56 
 
 		 81 aa  80.9  0.000000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.147687  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0162  hypothetical protein  55.56 
 
 		 81 aa  80.9  0.000000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0173  hypothetical protein  54.17 
 
 		 81 aa  79  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.441398  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0011  protein of unknown function DUF1150  45 
 
 		 85 aa  77.8  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000282298 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0446  hypothetical protein  47.5 
 
 		 85 aa  77.4  0.00000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0011  protein of unknown function DUF1150  43.75 
 
 		 85 aa  76.3  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0617045  normal  0.0877122 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4962  hypothetical protein  38.16 
 
 		 90 aa  52.8  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.780317  normal  0.980249 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0407  hypothetical protein  36.84 
 
 		 85 aa  42.4  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>