25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0446 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011989  Avi_0446  hypothetical protein  100 
 
 
85 aa  176  9e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0011  protein of unknown function DUF1150  81.18 
 
 
85 aa  150  7e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000282298 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0011  protein of unknown function DUF1150  81.18 
 
 
85 aa  150  7e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0617045  normal  0.0877122 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0048  hypothetical protein  76.47 
 
 
85 aa  140  4e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.725012  hitchhiker  0.0000000457362 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0173  hypothetical protein  52.63 
 
 
81 aa  90.9  6e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.441398  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0156  hypothetical protein  51.32 
 
 
81 aa  89  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.147687  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0162  hypothetical protein  51.32 
 
 
81 aa  89  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0513  hypothetical protein  48.68 
 
 
88 aa  84.3  5e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0055  protein of unknown function DUF1150  47.37 
 
 
88 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.308116  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0652  hypothetical protein  45.57 
 
 
88 aa  80.9  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0507627 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0181  hypothetical protein  45.45 
 
 
88 aa  80.9  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.489602  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1373  protein of unknown function DUF1150  45.12 
 
 
88 aa  81.3  0.000000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.620399 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2033  hypothetical protein  46.15 
 
 
89 aa  80.5  0.000000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3161  hypothetical protein  47.44 
 
 
94 aa  80.1  0.000000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.243875  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3664  hypothetical protein  46.05 
 
 
85 aa  80.5  0.000000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.805685  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0116  hypothetical protein  47.44 
 
 
87 aa  79.3  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.833113 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0168  hypothetical protein  47.37 
 
 
88 aa  78.6  0.00000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0212  hypothetical protein  45.45 
 
 
88 aa  78.6  0.00000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1615  protein of unknown function DUF1150  51.39 
 
 
98 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0149987  hitchhiker  0.0025404 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1621  hypothetical protein  47.5 
 
 
93 aa  77.4  0.00000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00907328 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1903  protein of unknown function DUF1150  47.5 
 
 
93 aa  77.4  0.00000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.557763 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0410  hypothetical protein  46.05 
 
 
87 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4229  hypothetical protein  43.42 
 
 
83 aa  71.6  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.611676  hitchhiker  0.00805122 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4739  protein of unknown function DUF1150  43.42 
 
 
83 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0438288  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2206  hypothetical protein  37.14 
 
 
75 aa  43.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>