25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4962 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_4962  hypothetical protein  100 
 
 
90 aa  177  5.999999999999999e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.780317  normal  0.980249 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0189  hypothetical protein  41.03 
 
 
99 aa  63.5  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.577781  normal  0.409086 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1615  protein of unknown function DUF1150  39.47 
 
 
98 aa  53.5  0.0000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0149987  hitchhiker  0.0025404 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1903  protein of unknown function DUF1150  38.16 
 
 
93 aa  52.8  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.557763 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1621  hypothetical protein  38.16 
 
 
93 aa  52.8  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00907328 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0684  protein of unknown function DUF1150  43.06 
 
 
75 aa  52  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.107687  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3161  hypothetical protein  35.42 
 
 
94 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.243875  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4229  hypothetical protein  36.9 
 
 
83 aa  50.4  0.000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.611676  hitchhiker  0.00805122 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2033  hypothetical protein  33.33 
 
 
89 aa  50.1  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4739  protein of unknown function DUF1150  35.9 
 
 
83 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0438288  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3664  hypothetical protein  31.11 
 
 
85 aa  47  0.00009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.805685  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1373  protein of unknown function DUF1150  34.62 
 
 
88 aa  46.2  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.620399 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0116  hypothetical protein  36.25 
 
 
87 aa  45.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.833113 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1573  hypothetical protein  41.67 
 
 
74 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0225  hypothetical protein  41.67 
 
 
74 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0407  hypothetical protein  36.84 
 
 
85 aa  44.7  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0652  hypothetical protein  34.44 
 
 
88 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0507627 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0513  hypothetical protein  26.97 
 
 
88 aa  44.3  0.0006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0410  hypothetical protein  35 
 
 
87 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0055  protein of unknown function DUF1150  34.62 
 
 
88 aa  43.5  0.0008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.308116  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3055  hypothetical protein  41.1 
 
 
74 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2206  hypothetical protein  40.26 
 
 
75 aa  43.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0181  hypothetical protein  35.9 
 
 
88 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.489602  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0011  protein of unknown function DUF1150  26.67 
 
 
85 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0617045  normal  0.0877122 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0168  hypothetical protein  33.33 
 
 
88 aa  40.8  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>