22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0189 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0189  hypothetical protein  100 
 
 		 99 aa  200  4e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.577781  normal  0.409086 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4962  hypothetical protein  41.03 
 
 		 90 aa  63.5  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.780317  normal  0.980249 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3664  hypothetical protein  42.11 
 
 		 85 aa  59.3  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.805685  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0684  protein of unknown function DUF1150  42.68 
 
 		 75 aa  55.1  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.107687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0652  hypothetical protein  32.18 
 
 		 88 aa  54.3  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0507627 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2206  hypothetical protein  45.31 
 
 		 75 aa  54.3  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0055  protein of unknown function DUF1150  31.58 
 
 		 88 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.308116  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0181  hypothetical protein  31.17 
 
 		 88 aa  51.6  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.489602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3055  hypothetical protein  47.14 
 
 		 74 aa  52  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0116  hypothetical protein  31.17 
 
 		 87 aa  52  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.833113 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2033  hypothetical protein  32.47 
 
 		 89 aa  50.4  0.000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0609  hypothetical protein  38.67 
 
 		 74 aa  49.3  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0918378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3349  hypothetical protein  37.5 
 
 		 75 aa  47  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1573  hypothetical protein  41.43 
 
 		 74 aa  46.2  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1373  protein of unknown function DUF1150  37.5 
 
 		 88 aa  46.2  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.620399 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0225  hypothetical protein  41.43 
 
 		 74 aa  46.2  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0410  hypothetical protein  28.95 
 
 		 87 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4229  hypothetical protein  35.14 
 
 		 83 aa  43.5  0.0009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.611676  hitchhiker  0.00805122 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0407  hypothetical protein  30.3 
 
 		 85 aa  42.7  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0168  hypothetical protein  31.17 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4739  protein of unknown function DUF1150  32.5 
 
 		 83 aa  42.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0438288  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0212  hypothetical protein  29.87 
 
 		 88 aa  41.2  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>