19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0083 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_0083  hypothetical protein  100 
 
 		 199 aa  394  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0959336  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3764  hypothetical protein  79.4 
 
 		 199 aa  286  2e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.159393  normal  0.0312174 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7032  hypothetical protein  40.19 
 
 		 109 aa  75.9  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6350  hypothetical protein  35.71 
 
 		 163 aa  55.1  0.0000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.041892  normal  0.708608 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4132  hypothetical protein  32.06 
 
 		 202 aa  48.9  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.228138 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5441  hypothetical protein  27.23 
 
 		 187 aa  47.8  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.394944 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1165  hypothetical protein  28.27 
 
 		 187 aa  46.6  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.137159 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1425  hypothetical protein  33.12 
 
 		 186 aa  46.2  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3833  hypothetical protein  31.82 
 
 		 176 aa  46.2  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.797851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5231  hypothetical protein  28.28 
 
 		 175 aa  45.4  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.376233 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3515  hypothetical protein  29.79 
 
 		 190 aa  44.7  0.0008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0617  hypothetical protein  28.29 
 
 		 197 aa  44.3  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.161317  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5287  hypothetical protein  29.21 
 
 		 178 aa  44.3  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.900899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2716  hypothetical protein  26.35 
 
 		 185 aa  43.5  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.451978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3017  hypothetical protein  31.82 
 
 		 187 aa  43.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1480  hypothetical protein  25.6 
 
 		 176 aa  43.1  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3766  hypothetical protein  25.29 
 
 		 225 aa  42  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.603513  normal  0.421355 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3624  hypothetical protein  28.27 
 
 		 185 aa  42  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.018546 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7491  hypothetical protein  28.93 
 
 		 163 aa  41.6  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.766065  normal  0.358935 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>