22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3764 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_3764  hypothetical protein  100 
 
 
199 aa  388  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.159393  normal  0.0312174 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0083  hypothetical protein  79.4 
 
 
199 aa  295  4e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0959336  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7032  hypothetical protein  41.75 
 
 
109 aa  73.2  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6350  hypothetical protein  35.77 
 
 
163 aa  54.7  0.0000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.041892  normal  0.708608 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2716  hypothetical protein  27.5 
 
 
185 aa  48.9  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.451978  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3833  hypothetical protein  29.69 
 
 
176 aa  48.5  0.00006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.797851  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3624  hypothetical protein  30.73 
 
 
185 aa  48.1  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.018546 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1353  hypothetical protein  29.27 
 
 
169 aa  47.4  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3515  hypothetical protein  34.51 
 
 
190 aa  45.4  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5441  hypothetical protein  26.74 
 
 
187 aa  45.1  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.394944 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4132  hypothetical protein  29.05 
 
 
202 aa  44.7  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.228138 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7395  hypothetical protein  28.43 
 
 
175 aa  43.9  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0967548  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5193  hypothetical protein  27.27 
 
 
180 aa  43.9  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.19201  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1425  hypothetical protein  30.32 
 
 
186 aa  44.3  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1789  hypothetical protein  27.62 
 
 
178 aa  44.3  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.288402  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5231  hypothetical protein  26.29 
 
 
175 aa  43.9  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.376233 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3017  hypothetical protein  30.32 
 
 
187 aa  43.5  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1480  hypothetical protein  29.03 
 
 
176 aa  42.7  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0617  hypothetical protein  25.48 
 
 
197 aa  42.7  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.161317  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6652  hypothetical protein  28.65 
 
 
175 aa  42  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00938181 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4259  hypothetical protein  28.67 
 
 
214 aa  41.6  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.464103 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3794  hypothetical protein  27.97 
 
 
214 aa  41.6  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.399094 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>