25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3766 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_3766  hypothetical protein  100 
 
 		 225 aa  442  1e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.603513  normal  0.421355 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4061  hypothetical protein  98.22 
 
 		 225 aa  432  1e-120  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.507546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4022  hypothetical protein  88.21 
 
 		 229 aa  290  1e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.270913  normal  0.652228 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1308  hypothetical protein  70.4 
 
 		 232 aa  234  9e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5183  hypothetical protein  75.58 
 
 		 229 aa  131  6.999999999999999e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0507401  normal  0.026116 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2290  hypothetical protein  31.25 
 
 		 233 aa  69.3  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.75728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0126  hypothetical protein  34.55 
 
 		 234 aa  65.5  0.0000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3728  hypothetical protein  31.62 
 
 		 235 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2103  hypothetical protein  31.58 
 
 		 236 aa  58.9  0.00000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00149204  normal  0.726583 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1767  hypothetical protein  31.58 
 
 		 236 aa  58.9  0.00000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2716  hypothetical protein  31.76 
 
 		 185 aa  54.3  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.451978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1527  hypothetical protein  31.58 
 
 		 236 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.178788  normal  0.568134 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6350  hypothetical protein  40.28 
 
 		 163 aa  52.4  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.041892  normal  0.708608 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4659  hypothetical protein  27.01 
 
 		 230 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3764  hypothetical protein  26.5 
 
 		 199 aa  49.3  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.159393  normal  0.0312174 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0750  hypothetical protein  25.25 
 
 		 241 aa  48.9  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5287  hypothetical protein  38.1 
 
 		 178 aa  48.5  0.00008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.900899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0129  hypothetical protein  30.56 
 
 		 201 aa  45.8  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.359868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0083  hypothetical protein  25.64 
 
 		 199 aa  43.9  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0959336  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5098  hypothetical protein  23.53 
 
 		 172 aa  43.5  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3254  hypothetical protein  28.57 
 
 		 185 aa  42.7  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.111604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3291  hypothetical protein  29.29 
 
 		 224 aa  42.7  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.743277 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5233  hypothetical protein  27.43 
 
 		 238 aa  42.4  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0279133  normal  0.15119 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3523  hypothetical protein  29.29 
 
 		 226 aa  42  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.858088  hitchhiker  0.00178282 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5231  hypothetical protein  25.61 
 
 		 175 aa  41.6  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.376233 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>