33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_1395 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_1395  hypothetical protein  100 
 
 
242 aa  499  1e-140  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.560951  normal  0.646093 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2503  hypothetical protein  24.44 
 
 
233 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.148433 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1711  hypothetical protein  28.73 
 
 
240 aa  60.1  0.00000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00140285  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7534  hypothetical protein  37.35 
 
 
260 aa  53.5  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5715  hypothetical protein  37.35 
 
 
260 aa  53.5  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6079  hypothetical protein  37.35 
 
 
260 aa  53.5  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6563  hypothetical protein  37.35 
 
 
260 aa  53.5  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.167257 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2363  hypothetical protein  42.62 
 
 
238 aa  52.8  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0698  putative cytoplasmic protein  23.5 
 
 
204 aa  53.1  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0344011  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2479  putative inner membrane protein  42.62 
 
 
238 aa  52.8  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6420  hypothetical protein  28.57 
 
 
286 aa  52.4  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.06619  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0759  hypothetical protein  22.95 
 
 
204 aa  51.6  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0772  hypothetical protein  22.95 
 
 
204 aa  51.6  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2370  hypothetical protein  40.98 
 
 
238 aa  51.6  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.593552 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0712  putative cytoplasmic protein  22.95 
 
 
204 aa  50.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.379869  normal  0.995963 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0738  hypothetical protein  22.7 
 
 
235 aa  50.4  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.691398 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1884  hypothetical protein  24.59 
 
 
231 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0669  hypothetical protein  22.7 
 
 
235 aa  49.3  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4188  hypothetical protein  21.98 
 
 
234 aa  49.3  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4473  protein of unknown function DUF1266  20.52 
 
 
234 aa  48.9  0.00007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.979526  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0676  hypothetical protein  22.16 
 
 
235 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2997  hypothetical protein  22.16 
 
 
235 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2978  protein of unknown function DUF1266  22.16 
 
 
235 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1784  hypothetical protein  22.58 
 
 
359 aa  45.8  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.853239  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0714  putative cytoplasmic protein  23.67 
 
 
231 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.347857  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1512  hypothetical protein  29.41 
 
 
224 aa  44.7  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.836675 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4553  hypothetical protein  33.33 
 
 
218 aa  44.7  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0896381  decreased coverage  0.00517061 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2632  hypothetical protein  21.13 
 
 
280 aa  43.9  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.388075  normal  0.505342 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2536  hypothetical protein  28.3 
 
 
255 aa  44.3  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.484467 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0774  hypothetical protein  23.49 
 
 
231 aa  43.5  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0700  putative cytoplasmic protein  23.49 
 
 
231 aa  43.5  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.178652  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0761  hypothetical protein  23.49 
 
 
231 aa  43.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.538719  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3339  hypothetical protein  22.83 
 
 
251 aa  43.1  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>