26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_1884 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_1884  hypothetical protein  100 
 
 		 231 aa  478  1e-134  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2978  protein of unknown function DUF1266  41.03 
 
 		 235 aa  154  8e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2997  hypothetical protein  41.03 
 
 		 235 aa  154  8e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0676  hypothetical protein  41.45 
 
 		 235 aa  154  8e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0669  hypothetical protein  38.53 
 
 		 235 aa  152  5e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0738  hypothetical protein  38.96 
 
 		 235 aa  151  8e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.691398 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4473  protein of unknown function DUF1266  37.66 
 
 		 234 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.979526  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4188  hypothetical protein  36.91 
 
 		 234 aa  146  3e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0735  hypothetical protein  37.18 
 
 		 235 aa  138  7e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.622505 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0774  hypothetical protein  34.93 
 
 		 231 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0761  hypothetical protein  34.93 
 
 		 231 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.538719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0700  putative cytoplasmic protein  34.93 
 
 		 231 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.178652  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0714  putative cytoplasmic protein  34.93 
 
 		 231 aa  136  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.347857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0666  hypothetical protein  36.64 
 
 		 235 aa  135  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.40885  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00614  hypothetical protein  36.75 
 
 		 235 aa  134  9e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00603  hypothetical protein  36.75 
 
 		 235 aa  134  9e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0772  hypothetical protein  38.34 
 
 		 204 aa  132  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0759  hypothetical protein  38.34 
 
 		 204 aa  132  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0698  putative cytoplasmic protein  37.82 
 
 		 204 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0344011  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2981  protein of unknown function DUF1266  41.28 
 
 		 235 aa  129  3e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3000  hypothetical protein  41.28 
 
 		 235 aa  129  3e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0712  putative cytoplasmic protein  37.82 
 
 		 204 aa  129  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.379869  normal  0.995963 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0673  hypothetical protein  40.7 
 
 		 235 aa  126  3e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.143249  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1395  hypothetical protein  25.16 
 
 		 242 aa  47.8  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.560951  normal  0.646093 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2503  hypothetical protein  22.73 
 
 		 233 aa  43.5  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.148433 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6420  hypothetical protein  25.97 
 
 		 286 aa  43.5  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.06619  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>