14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6420 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6420  hypothetical protein  100 
 
 		 286 aa  591  1e-168  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.06619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1884  hypothetical protein  27.59 
 
 		 306 aa  62.4  0.000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3339  hypothetical protein  25.1 
 
 		 251 aa  56.6  0.0000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2503  hypothetical protein  23.78 
 
 		 233 aa  55.5  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.148433 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1395  hypothetical protein  28.57 
 
 		 242 aa  52.8  0.000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.560951  normal  0.646093 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2902  group-specific protein  27.45 
 
 		 225 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.58521  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2975  hypothetical protein  27.45 
 
 		 225 aa  47.8  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3200  hypothetical protein  27.45 
 
 		 225 aa  47.8  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.851547  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2063  hypothetical protein  21.43 
 
 		 357 aa  44.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0735  hypothetical protein  24.38 
 
 		 235 aa  43.9  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.622505 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1884  hypothetical protein  25.97 
 
 		 231 aa  43.5  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0738  hypothetical protein  23.95 
 
 		 235 aa  42.4  0.008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.691398 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00614  hypothetical protein  23.75 
 
 		 235 aa  42  0.01  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00603  hypothetical protein  23.75 
 
 		 235 aa  42  0.01  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>