22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_3339 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_3339  hypothetical protein  100 
 
 
251 aa  515  1.0000000000000001e-145  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1711  hypothetical protein  33.92 
 
 
240 aa  99.8  4e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00140285  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1884  hypothetical protein  34.27 
 
 
306 aa  89.4  5e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2501  hypothetical protein  29.61 
 
 
247 aa  65.9  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0527834  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2632  hypothetical protein  24.5 
 
 
280 aa  63.9  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.388075  normal  0.505342 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4553  hypothetical protein  27.08 
 
 
218 aa  63.2  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0896381  decreased coverage  0.00517061 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2536  hypothetical protein  24.19 
 
 
255 aa  61.6  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.484467 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0720  Serine/threonine protein kinase-related protein  26.64 
 
 
584 aa  61.2  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6420  hypothetical protein  25.1 
 
 
286 aa  56.6  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.06619  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2975  hypothetical protein  29.84 
 
 
225 aa  53.5  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3200  hypothetical protein  29.84 
 
 
225 aa  53.5  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.851547  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2902  group-specific protein  29.84 
 
 
225 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.58521  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2503  hypothetical protein  27.27 
 
 
233 aa  52.4  0.000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.148433 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1331  hypothetical protein  21.16 
 
 
419 aa  44.7  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4473  protein of unknown function DUF1266  32 
 
 
234 aa  44.3  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.979526  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0714  putative cytoplasmic protein  23.66 
 
 
231 aa  42.7  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.347857  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0676  hypothetical protein  31.03 
 
 
235 aa  42.7  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0700  putative cytoplasmic protein  23.66 
 
 
231 aa  42.4  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.178652  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4188  hypothetical protein  35.48 
 
 
234 aa  42.4  0.007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0774  hypothetical protein  23.66 
 
 
231 aa  42.4  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2997  hypothetical protein  31.33 
 
 
235 aa  42.4  0.008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2978  protein of unknown function DUF1266  31.33 
 
 
235 aa  42.4  0.008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>