40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2503 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_2503  hypothetical protein  100 
 
 		 233 aa  484  1e-136  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.148433 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1395  hypothetical protein  23.98 
 
 		 242 aa  69.3  0.00000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.560951  normal  0.646093 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1884  hypothetical protein  24.86 
 
 		 306 aa  67.4  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2632  hypothetical protein  25.79 
 
 		 280 aa  64.3  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.388075  normal  0.505342 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1784  hypothetical protein  26.32 
 
 		 359 aa  63.9  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.853239  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3161  hypothetical protein  23.58 
 
 		 329 aa  58.2  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4473  protein of unknown function DUF1266  24.66 
 
 		 234 aa  57.4  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.979526  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4188  hypothetical protein  24.66 
 
 		 234 aa  57  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2975  hypothetical protein  27.45 
 
 		 225 aa  55.5  0.0000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3200  hypothetical protein  27.45 
 
 		 225 aa  55.5  0.0000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.851547  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6420  hypothetical protein  23.78 
 
 		 286 aa  55.5  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.06619  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2902  group-specific protein  28.78 
 
 		 225 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.58521  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3339  hypothetical protein  27.27 
 
 		 251 aa  52.4  0.000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0720  Serine/threonine protein kinase-related protein  28.28 
 
 		 584 aa  51.2  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1885  hypothetical protein  21.4 
 
 		 256 aa  50.8  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0772  hypothetical protein  26.86 
 
 		 204 aa  50.1  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0759  hypothetical protein  26.86 
 
 		 204 aa  50.1  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1331  hypothetical protein  30.34 
 
 		 419 aa  48.9  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2501  hypothetical protein  25.43 
 
 		 247 aa  48.5  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0527834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0712  putative cytoplasmic protein  26.86 
 
 		 204 aa  48.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.379869  normal  0.995963 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2363  hypothetical protein  30.43 
 
 		 238 aa  47  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2479  putative inner membrane protein  30.43 
 
 		 238 aa  47  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0698  putative cytoplasmic protein  26.29 
 
 		 204 aa  47  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0344011  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2370  hypothetical protein  30 
 
 		 238 aa  46.2  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.593552 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00614  hypothetical protein  24.4 
 
 		 235 aa  45.8  0.0006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00603  hypothetical protein  24.4 
 
 		 235 aa  45.8  0.0006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3000  hypothetical protein  24.7 
 
 		 235 aa  45.4  0.0007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2981  protein of unknown function DUF1266  24.7 
 
 		 235 aa  45.4  0.0007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0673  hypothetical protein  23.22 
 
 		 235 aa  45.4  0.0007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.143249  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0735  hypothetical protein  24.7 
 
 		 235 aa  45.1  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.622505 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7534  hypothetical protein  33.68 
 
 		 260 aa  43.9  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2536  hypothetical protein  28.12 
 
 		 255 aa  44.3  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.484467 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1884  hypothetical protein  22.73 
 
 		 231 aa  43.5  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0774  hypothetical protein  25.19 
 
 		 231 aa  42.7  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0700  putative cytoplasmic protein  25.19 
 
 		 231 aa  42.7  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.178652  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0714  putative cytoplasmic protein  25.19 
 
 		 231 aa  42.7  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.347857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0761  hypothetical protein  25.19 
 
 		 231 aa  42.4  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.538719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1180  hypothetical protein  21.83 
 
 		 311 aa  42  0.008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6079  hypothetical protein  32.63 
 
 		 260 aa  42  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5715  hypothetical protein  32.63 
 
 		 260 aa  42  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>